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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] NCBI上传序列的问题急切

扩增了一段基因部分片段（cDNA扩增），bankit上传，到feature阶段，因为是可翻译基因，选择cDS，但粘贴上氨基酸序列后，出现错误，说我的核酸序列不够长，不足以翻译蛋白，请上传正确序列。可是我扩增的就是partial sequence。不知如何进行了，我的核酸序列450bp。急求相关大神帮忙！！！大巴金币送上

[ Last edited by liusir3836 on 2014-1-25 at 20:58 ]

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1楼 2014-01-25 16:17:35

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seizetheday

新虫 (初入文坛)

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专业: 植物病理学

【答案】应助回帖

在feature阶段，是要对核酸序列做出注释，即从第几个碱基到第几个碱基编码的是什么蛋白，先在txt文件中注释好了，再上传上去即可，如果出现错误会提示。下面是一个例子：
>Feature Seq1
<75 104 CDS
167 200
253 >546
               product histone
               codon_start 2
<75 104 mRNA
167 200
253 >546
                    product histone
>Feature Seq2
<75 104 CDS
167 200
253 >546
               product histone
               codon_start 2
<75 104 mRNA
167 200
253 >546
                    product histone
>Feature Seq3
<22 51 CDS
113 >440
               product histone
               codon_start 1
<22 51 mRNA
113 >440
                    product histone