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cxfans铁杆木虫 (著名写手)
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[求助]
NCBI上传序列的问题 急 切
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扩增了一段基因部分片段（cDNA扩增），bankit上传，到feature阶段，因为是可翻译基因，选择cDS，但粘贴上氨基酸序列后，出现错误，说我的核酸序列不够长，不足以翻译蛋白，请上传正确序列。可是我扩增的就是partial sequence。不知如何进行了，我的核酸序列450bp。急求相关大神帮忙！！！大巴金币送上 [ Last edited by liusir3836 on 2014-1-25 at 20:58 ] |
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cxfans
铁杆木虫 (著名写手)
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- 应助: 15 (小学生)
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- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
2楼2014-01-25 16:31:31
【答案】应助回帖
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在feature阶段，是要对核酸序列做出注释，即从第几个碱基到第几个碱基编码的是什么蛋白，先在txt文件中注释好了，再上传上去即可，如果出现错误会提示。下面是一个例子： >Feature Seq1 <75 104 CDS 167 200 253 >546 product histone codon_start 2 <75 104 mRNA 167 200 253 >546 product histone >Feature Seq2 <75 104 CDS 167 200 253 >546 product histone codon_start 2 <75 104 mRNA 167 200 253 >546 product histone >Feature Seq3 <22 51 CDS 113 >440 product histone codon_start 1 <22 51 mRNA 113 >440 product histone |
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