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707462558

银虫 (著名写手)

[求助] vasp 静态计算出错 已有1人参与

mpirun noticed that process rank 8 with PID 10701 on node localhost.localdomain exited on signal 1 (Hangup).
算了几次静态都出现这个错误,算不下去了,中断了,大家遇到过吗
vasp 静态计算出错
N6FUJXIBAHDA)7@7~V9MIN4.jpg
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shawwww

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也出现过这种错误,可能是堆栈的问题,你输入ulimit -s unlimited 后再启动计算试试!
12楼2014-01-24 15:20:22
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shawwww

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
707462558: 金币+10 2014-01-25 09:40:18
我也是遇到这种情况的时候在网上找到的方法,试了一下就问题就解决了。方法是在服务器没有运算的情况下在客户端光标处输入ulimit -s unlimited ,按回车,然后再启动VASP计算!
14楼2014-01-24 22:37:31
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

http://www.tutorialspoint.com/unix/unix-signals-traps.htm

.....exited on signal 1 (HANGUP)
?@??t???? LINUX ????? job ??????
HANGUP ???ǒ??(??)?????
user ?c OS ??g???????
???v??????????
???v?~???????
??????f~ OS ??????????]????????
???ж? "?]?л??" ??? HANGUP
?l??????к????N????

?????????CPU??? ( & ?@?N?G???????????)
??????? terminal ?P??~ ???????l???@?N HANGUP
???????o mpich ?????л??\??
???"????"???治??
?"????" stack size ????? ( ????? ulimit -s unlimited)
?"????" ????w????????} (?C???^?????????^???T?????)
?к????? "????"
18楼2014-01-28 15:55:27
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

???????:
19?: Originally posted by 707462558 at 2014-01-28 19:28:54
?????????????????????????????????????????????????????????????ζ??????????...

??????????w????}
????????f~?@???????
??X??w?@?|???f????
???S??????????C?????~ ???????????????

??w?????}??????????]??
???C?????hС???w
(????????????????^??????y???]???})

????f~??l?]?????c??????~????e???·
?@???w??????ζ????F?????}
??S???????????c????????}???????????????????@Щ?????}????c
(???????????e????c???????????Q???C??????)
??S?@?????y??INCAR???Щ??????????@??y?l???????A????e?`
(???Щ???????????????????v?? IALGO=38 or ISYM=0)
??S?@????? vasp ?e??? bug
(????? VASP forum ?l??~ ???_?l??????????????????????)
??S~~????????S
?????Q??????T???????????c
20楼2014-01-28 20:39:29
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普通回帖

707462558

银虫 (著名写手)

顶起来
无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
2楼2014-01-23 08:59:05
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华科小豆豆

新虫 (小有名气)

遇见过,而且我的好像也是计算36步就停了。你设置的INCAR是什么?可以看看吗?
3楼2014-01-23 09:46:09
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wujiandongde

木虫 (小有名气)

1.尽量在一个节点的运行任务
2.修改IALGO=38试试
3.ISYM=0

希望有所效果
4楼2014-01-23 09:48:25
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707462558

银虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wujiandongde at 2014-01-23 09:48:25
1.尽量在一个节点的运行任务
2.修改IALGO=38试试
3.ISYM=0

希望有所效果

我本来的设置就是 IALGO=38,但是没有 ISYM=0,ISYM=0是什么意思呀  我算的好几个相似的体系 别的都没有问题 就这个出现这个问题,只这个体系加ISYM=0会不会影响啊  重复好多遍每次都算到36个电子步就断了
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5楼2014-01-23 10:12:12
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707462558

银虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 华科小豆豆 at 2014-01-23 09:46:09
遇见过,而且我的好像也是计算36步就停了。你设置的INCAR是什么?可以看看吗?

这是INCAR
vasp 静态计算出错-1
111111111111.jpg

无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
6楼2014-01-23 10:18:14
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wujiandongde

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 707462558 at 2014-01-23 10:12:12
我本来的设置就是 IALGO=38,但是没有 ISYM=0,ISYM=0是什么意思呀  我算的好几个相似的体系 别的都没有问题 就这个出现这个问题,只这个体系加ISYM=0会不会影响啊  重复好多遍每次都算到36个电子步就断了...

ISYM=0只是取消对称性,内存需要大一点,我是在这里看到的 http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b14ba7e01014kks.html
7楼2014-01-23 11:02:47
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707462558

银虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wujiandongde at 2014-01-23 11:02:47
ISYM=0只是取消对称性,内存需要大一点,我是在这里看到的 http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b14ba7e01014kks.html...

对称性可以随便取消吗  ,取消了会怎么样呢
无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
8楼2014-01-23 11:22:03
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wujiandongde

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 707462558 at 2014-01-23 11:22:03
对称性可以随便取消吗  ,取消了会怎么样呢...

这个关系不大,增加对称性只是为了减少计算量
9楼2014-01-23 11:23:50
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707462558

银虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wujiandongde at 2014-01-23 11:23:50
这个关系不大,增加对称性只是为了减少计算量...

加这个是增加对称性了 是吧,我的体系本来是有它自身对称性的
无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
10楼2014-01-23 11:30:56
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