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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用vasp优化CO结构，机器不算，不知道哪出错了？高手来帮帮我！ 已有3人参与

各位前辈，大家好：
我想用vasp优化CO的结构，结果机器不算，我把我的结果贴出来，希望高手来看看到底是哪里出错了？
JOBID: 43569.cn061
  The job was started at Wed Jan 22 13:30:29 CST 2014
  The job was running at cn015.
running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  C  O
POSCAR found :  2 types and       2 ions
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 2 with PID 14351 on
node cn015 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
  The job was finished at Wed Jan 22 13:30:32 CST 2014
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好好研究，天天向上！
1楼 2014-01-22 13:51:53
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小小鑫000: 金币+3, ★有帮助 2014-01-23 11:29:15
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-01-23 09:15:56
我已反复检查了我的POTCAR，没有问题呀，我想是不是其他的输入文件有误，造成了跟POTCAR不配，我把我的其他三个文件贴出来。
POSCAR：
CO file
1.0
        8.0000000000         0.0000000000         0.0000 ...

你把POSCAR改成下面的形式再试一下：
sys=CO
1.00     
8.50  0.00  0.00
0.00  8.30  0.00
0.00  0.00  8.00
  1  1
Selective dynamics
Direct
0.000  0.000  0.000  F  F  F
0.000  0.000  0.140  T  T  T
赞一下 回复此楼
6楼2014-01-23 11:01:34
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小小鑫000: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-01-22 17:20:38
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR

POTCAR 有問題
可能是損毀或是什麼的..
簡查看看
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-22 14:20:34
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-01-22 14:20:34
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR

POTCAR 有問題
可能是損毀或是什麼的..
簡查看看

我的POTCAR是利用cat POTCAR.C POTCAR.O>POTCAR 命令分别将C和O两个POTCAR合并起来的 ，难道这样合并不对吗？还望前辈指导！
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好好研究，天天向上！
3楼2014-01-22 17:25:42
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
???????:
3?: Originally posted by СС??000 at 2014-01-22 17:25:42
???POTCAR??????cat POTCAR.C POTCAR.O>POTCAR ??????C??O????POTCAR????????? ?????????????????????????????...

????????~???l?????????
??? error message
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
??????V??
vasp ?x POTCAR ?x???????~?e?????????
???? POTCAR.C or POTCAR.O ????????}
??????N??N???????}?l??~~
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4楼2014-01-22 17:34:04
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