24小时热门版块排行榜    

查看: 5558  |  回复: 29
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用vasp优化CO结构,机器不算,不知道哪出错了?高手来帮帮我! 已有3人参与

各位前辈,大家好:
我想用vasp优化CO的结构,结果机器不算,我把我的结果贴出来,希望高手来看看到底是哪里出错了?
JOBID: 43569.cn061
  The job was started at Wed Jan 22 13:30:29 CST 2014
  The job was running at cn015.
running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  C  O
POSCAR found :  2 types and       2 ions
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 2 with PID 14351 on
node cn015 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001138CB7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001136FF2  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000001102554  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C94E0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010C9130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E956A  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000010E8B8F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000050C1CB  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000446641  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000044418A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003BFA01D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000004440B1  Unknown               Unknown  Unknown
  The job was finished at Wed Jan 22 13:30:32 CST 2014
--------------------------------------------------------
回复此楼

» 本帖@通知

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

好好研究,天天向上!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jpchou at 2014-01-22 17:34:04
指令是對的~但發生啥事不曉得
因為 error message
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
就是告訴你
vasp 讀 POTCAR 讀的很辛苦~裡面的內 ...

我已反复检查了我的POTCAR,没有问题呀,我想是不是其他的输入文件有误,造成了跟POTCAR不配,我把我的其他三个文件贴出来。
POSCAR:
CO file
1.0
        8.0000000000         0.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         8.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000         8.0000000000
    C    O
    1    1
Direct
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
     0.000000000         0.000000000         0.141039997
INCAR:
SYSTEM = CO
ENCUT = 520
ISTART = 0; ICHARG = 2
ISMEAR = 1; SIGMA = 0.1
NSW = 60; IBRION = 2
ISIF = 2
POTIM = 0.2
EDIFF = 1E-6; EDIFFG = -1E-3
PREC = Accurate
KPOINTS:
Gamma-point only
1        
rec      
0 0 0 1  
求前辈帮我仔细看一下这三个文件设置的是否合理?
好好研究,天天向上!
5楼2014-01-23 09:15:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-01-22 17:20:38
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR

POTCAR 有問題
可能是損毀或是什麼的..
簡查看看
2楼2014-01-22 14:20:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-01-22 14:20:34
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR

POTCAR 有問題
可能是損毀或是什麼的..
簡查看看

我的POTCAR是利用cat POTCAR.C POTCAR.O>POTCAR 命令分别将C和O两个POTCAR合并起来的 ,难道这样合并不对吗?还望前辈指导!
好好研究,天天向上!
3楼2014-01-22 17:25:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)

???????:
3?: Originally posted by СС??000 at 2014-01-22 17:25:42
???POTCAR??????cat POTCAR.C POTCAR.O>POTCAR ??????C??O????POTCAR????????? ?????????????????????????????...

????????~???l?????????
??? error message
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 10, file /data/tmp/lhkang/43569.cn061/POTCAR
??????V??
vasp ?x POTCAR ?x???????~?e?????????
???? POTCAR.C or POTCAR.O ????????}
??????N??N???????}?l??~~
4楼2014-01-22 17:34:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见