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心转角

新虫 (初入文坛)

[求助] Warning:Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far 已有3人参与

运行过程中一直出现
WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
manual解释是This can cause LAMMPS to crash when the neighbor list is built. The solution is to check for building the
regular neighbor lists more frequently。
我把neighbor   2.0 bin中2.0试着改了好多次,减小或者增大,但是都会出现一样的
警告WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
或者错误:原子丢失。
我到底该怎么修改,修改什么东西。
求大侠指点
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慕枫染

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主,您好,我也碰到了同样的问题,请问您解决了吗?
人生没有失败
5楼2014-12-08 11:06:20
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查看全部 5 个回答

心转角

新虫 (初入文坛)

求解答。。目前又出现ERROR: Lost atoms: original 10000 current 9996
2楼2014-01-17 15:48:17
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zjnu_yc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-03-22 14:03:21
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-03-22 14:03:26
关于atom loss的问题我也碰到过,起初我以为是我的simulation box设置问题,后来我按照LOG文件的一个WARNING修改了pair_style不匹配问题以后,atom loss 问题也解决了,整个IN文件得以顺利计算下去。楼主不妨看看系统有没有出现类似的提示。
3楼2014-03-22 10:37:38
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xy515258

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-03-24 19:14:27
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-03-24 19:14:34
不知道是再哪个过程lost atom了?    是一开始建盒子和原子就丢了?还是有了操作开始才丢?我也经常丢原子。  但是一般是后者。  通过缩小步长或者修改Tdamp之类的参数可以解决。  感觉步长缩小永远是管用的。     如果是一开始就丢了。  我觉得是不是创建原子时候问题?      还有。  lammps给出的解释是要你生成neighbor列表更频繁点。  而你修改bin前面的数字改的是距离啊。     当然不会有用。  试试neigh-modify修改时间间隔?     同新手。 只能给你这么多意见了。
4楼2014-03-24 18:50:30
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