24小时热门版块排行榜    

查看: 1019  |  回复: 4

心转角

新虫 (初入文坛)

[求助] Warning:Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far 已有3人参与

运行过程中一直出现
WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
manual解释是This can cause LAMMPS to crash when the neighbor list is built. The solution is to check for building the
regular neighbor lists more frequently。
我把neighbor   2.0 bin中2.0试着改了好多次,减小或者增大,但是都会出现一样的
警告WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453)
或者错误:原子丢失。
我到底该怎么修改,修改什么东西。
求大侠指点
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

心转角

新虫 (初入文坛)

求解答。。目前又出现ERROR: Lost atoms: original 10000 current 9996
2楼2014-01-17 15:48:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjnu_yc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-03-22 14:03:21
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-03-22 14:03:26
关于atom loss的问题我也碰到过,起初我以为是我的simulation box设置问题,后来我按照LOG文件的一个WARNING修改了pair_style不匹配问题以后,atom loss 问题也解决了,整个IN文件得以顺利计算下去。楼主不妨看看系统有没有出现类似的提示。
3楼2014-03-22 10:37:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy515258

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-03-24 19:14:27
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-03-24 19:14:34
不知道是再哪个过程lost atom了?    是一开始建盒子和原子就丢了?还是有了操作开始才丢?我也经常丢原子。  但是一般是后者。  通过缩小步长或者修改Tdamp之类的参数可以解决。  感觉步长缩小永远是管用的。     如果是一开始就丢了。  我觉得是不是创建原子时候问题?      还有。  lammps给出的解释是要你生成neighbor列表更频繁点。  而你修改bin前面的数字改的是距离啊。     当然不会有用。  试试neigh-modify修改时间间隔?     同新手。 只能给你这么多意见了。
4楼2014-03-24 18:50:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

慕枫染

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主,您好,我也碰到了同样的问题,请问您解决了吗?
人生没有失败
5楼2014-12-08 11:06:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 心转角 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 11:51 by xiangy672
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见