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shalimar1989

新虫 (初入文坛)

[求助] 大肠杆菌RNA提取求大虾帮忙 已有2人参与

本人要提取大肠杆菌的RNA做荧光定量PCR,本以为大肠的很好提,没想到提了1个多月也没有好结果,求指导!!!拜谢啊
我的问题如下:
1 菌液量如何控制,有报道说要10 +7数量级的细胞,可是1od菌浓度就已经10 +8数量级了吧?难道1OD的菌液就要稀释10倍?我稀释以后菌量很少
   根本提不出来,应该怎么去菌液呢?麻烦大虾指导清楚点,一般OD多少菌液取多少毫升,加多少Trizol?
2 加Trizol要反复吹打吗?静置多久合适?
3 加异丙醇后需要静置吗?多久合适?其实我没静置时也有提出来过,见图,只是降解严重也有DNA污染,会不会不静置沉淀不充分呢?
4 我发现用试管的菌液提取相对容易,而我转摇瓶发酵后就很难提取出来RNA了,取样也处于生长期的菌体,这个是什么问题呢???

图中是我提的试管培养12小时的菌液,没稀释,还能出现条带,发酵的菌液根本提不出来,一条带也没有,到底怎么回事呢。。。
大肠杆菌RNA提取求大虾帮忙
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eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助! 2014-01-05 16:16:15
最好还是用kit提吧, 所有器具都用RNase Zap 擦洗避免RNAJ降解, 然后用RNase free 的 DNase 降解DNA
2楼2014-01-05 11:04:12
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shalimar1989

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2014-01-05 11:04:12
最好还是用kit提吧, 所有器具都用RNase Zap 擦洗避免RNAJ降解, 然后用RNase free 的 DNase 降解DNA

已经买了TRIZOL了,如果能不换就不太想买试剂盒了。。。谢谢
3楼2014-01-05 12:04:30
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yangpanfei

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

4楼2014-01-07 11:52:53
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shalimar1989

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yangpanfei at 2014-01-07 11:52:53
加Trizol后涡旋震荡30s,冰上放置15min;
加异丙醇后冰上放置0.5h;

请问你试过吗?放置半小时不是都降解吗?快速提取不是最重要的吗?有人说省去放置的时间,要快提才行,放置半小时。。。请问大侠有这样提过吗?效果好?
5楼2014-01-07 13:09:19
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yangpanfei

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2014-01-07 15:04:52
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shalimar1989

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yangpanfei at 2014-01-07 15:04:52
我之前提过酵母的RNA,不过刚才说错了,加异丙醇后-20度放置半小时,这点时间是不能省的...

你的意思是要保证沉淀充分是吗?菌量有控制吗?
7楼2014-01-07 21:43:04
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irufver

新虫 (初入文坛)

楼主想问一下你提出来没?我正准备提,也是想从发酵液中提RNA,但是我在纠结何时取样比较好。
8楼2015-05-06 19:06:21
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mabinbin0209

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by irufver at 2015-05-06 19:06:21
楼主想问一下你提出来没?我正准备提,也是想从发酵液中提RNA,但是我在纠结何时取样比较好。

你好,我最近也想提一下大肠的RNA,但是每次都降解,,请问你提出来了吗,可否指点一二
9楼2015-12-02 20:22:46
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mabinbin0209

新虫 (初入文坛)

请问楼主,是否提出来未降解的RNA,求指点,本人最近一直在提,但是总是遇到跟你一样的问题,降解非常明显
10楼2015-12-02 20:25:00
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