应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 碳纳米管MD模拟中积分时间步长选取时存在的问题
51/1返回列表
查看: 2959  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

newhoperoad

木虫 (正式写手)

[交流] 碳纳米管MD模拟中积分时间步长选取时存在的问题

在使用MS的discover模拟碳纳米管，随意建立一个碳纳米管模型，然后在setup中选择compass力场，其他选择默认；dynamics中选择NPT系综，步数设置为500000，积分时间步长设定为1fs 或者0.5fs，温度使用Anderrsen控制在室温298K，其他为默认值；然后开始计算，计算中出现的问题是：温度波动很大，无法保持温度恒定在298K，这是为什么呢？
对于强悍的MS，不应该在这么基本的运算上出问题啊？请指教，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2014-01-03 10:40:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanhan1020

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你改控温器  Nose 试试
赞一下 回复此楼
7楼2014-01-03 16:17:11
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

newhoperoad

木虫 (正式写手)
我猜想，是不是因为碳纳米管是自身非常稳定的刚性结构，在自身结构平衡的基础上，任何一点的外界环境变化，都会引起分子结构整体连锁式的运动，从而使动能增加，温度升高。不知道是不是这样的，或者有别的什么原因？
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-03 13:58:11
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanhan1020

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
newhoperoad: 金币+5, 第一个回复，谢谢啦 2014-01-03 20:00:52
恒定在298K?你所谓的恒定是什么意思？只要在298+—10k内都算可以，如果是后期波动大 考虑噪音项影响
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-03 15:52:14
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

newhoperoad

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hanhan1020 at 2014-01-03 15:52:14
恒定在298K?你所谓的恒定是什么意思？只要在298+—10k内都算可以，如果是后期波动大 考虑噪音项影响

波动超过了+-10K，请问您说的噪音项指的是精度吗？

[ Last edited by newhoperoad on 2014-1-3 at 16:15 ]
赞一下 回复此楼
5楼2014-01-03 16:09:24
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭