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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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菜菜0929

木虫 (小有名气)

[求助] 求助荧光定量PCR引物设计 已有5人参与

如题,我们课题组转录组测序得到了一些基因的序列,想在选出一些基因,想做荧光定量PCR,要怎么设计引物呢?是拿得到的序列直接设计?还是把序列比对到NCBI找相似的序列设计呢?
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 菜菜0929 at 2014-01-03 10:34:39
可是有些基因只有300多bp,能比对的上吗...

比对的是你的目的片段,PCR产物只要200以内深圳50bp都没有问题,当然够了
6楼2014-01-03 10:38:34
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lf6220

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-05 15:45:58
直接根据序列设计引物

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-01-03 09:15:42
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-04 18:45:47
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-01-05 15:46:06
可以将序列NCBI BLAST比对,找出序列特异位点设计引物探针,保证PCR的特异性
3楼2014-01-03 10:06:43
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菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lf6220 at 2014-01-03 09:15:42
直接根据序列设计引物

你是这样做的吗?我关键考虑到测序的出来毕竟是拼接出来的吗,这样直接设计可以吗?
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
4楼2014-01-03 10:33:27
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