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junjun0711

新虫 (小有名气)

应助: 4 (幼儿园)
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虫号: 2002913
注册: 2012-09-15
专业: 皮肤及其附属器疾病其他科

[求助] 小分子很少怎么做虚拟筛选啊！！已有2人参与

我有一味中药，早已应用于临床，治疗某病效果很好，只有十五个成分，老板希望试一试看这些小分子和某病靶点如何作用的，因为分子数太少，分子对接后没有一个小分子的打分能高于靶点蛋白原配体的打分，根本筛不出，实验室不是做计算这块，我也很菜鸟，希望有前辈能指点指点。

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同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？已经有6人回复
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1楼 2014-01-02 16:58:34

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monsoncupid

金虫 (小有名气)

应助: 18 (小学生)
金币: 1629.9
红花: 3
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在线: 47.9小时
虫号: 2637881
注册: 2013-09-05
专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 17:07:43

意思就是一共才十几个关键成分，逐个提取出来，然后与你的靶标蛋白相互作用，测定荧光紫外光谱，然后再根据什么stern-volmer方程之类的算什么猝灭常数之类之类的，分析一番哪个组分的相互作用比较强烈，然后存在相互作用的几个组分再做分子对接，Cdocker 不行就 flexible docking 、libdock 之类的对接程序挨个试，看哪个打分高就搞定了