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分子模拟中MSD的问题讨论
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首先我先交代一下背景哈：我现在用Materials Studio 做分子模拟，研究的主要是高压下的膜气体分离的问题； 然后说一下细节：在做气体在膜中的扩散模拟的时候，需要用到（均方位移曲线）MSD，大多数的文献中对于得到MSD的模拟都是用的Forcite中的NVT动力学模拟再分析得到； 问题来了： 1、但是因为我的模拟需要考虑高压的问题，NVT并没有压力的设定啊，是不是可以认为压力为0呢？ 2、请问我可以用NPT来模拟这个过程吗？如果用NPT模拟的话，膜晶格的密度肯定会变化啊（现实中膜材料的密度肯定是不变的） 这个问题实在是让我纠结啊！  3、如果都不行的话，这个压力的因素怎样和扩散联系起来呢？ 4、计算自由体积时，分子探针半径大小该怎么选择呢？ 上次发问题好多回帖的是来蹭金币的  ，这次改为手动发放金币了，希望有明白的同仁，能给指点一二 ，只要问题能解决，金币我不在乎，可以无限追加！[ Last edited by zhl1987091 on 2014-1-6 at 09:50 ] |
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