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zhl1987091

木虫 (小有名气)


[交流] 分子模拟中MSD的问题讨论

首先我先交代一下背景哈:我现在用Materials Studio 做分子模拟,研究的主要是高压下的膜气体分离的问题;
然后说一下细节:在做气体在膜中的扩散模拟的时候,需要用到(均方位移曲线)MSD,大多数的文献中对于得到MSD的模拟都是用的Forcite中的NVT动力学模拟再分析得到;
问题来了:
1、但是因为我的模拟需要考虑高压的问题,NVT并没有压力的设定啊,是不是可以认为压力为0呢?
2、请问我可以用NPT来模拟这个过程吗?如果用NPT模拟的话,膜晶格的密度肯定会变化啊(现实中膜材料的密度肯定是不变的)
这个问题实在是让我纠结啊!
3、如果都不行的话,这个压力的因素怎样和扩散联系起来呢?
4、计算自由体积时,分子探针半径大小该怎么选择呢?


上次发问题好多回帖的是来蹭金币的,这次改为手动发放金币了,希望有明白的同仁,能给指点一二,只要问题能解决,金币我不在乎,可以无限追加!

[ Last edited by zhl1987091 on 2014-1-6 at 09:50 ]
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笑笑愁

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhl1987091 at 2014-01-02 15:33:01
在前面做吸附溶解模拟的过程中有用到这个GCMC,比如说我做扩散要用到的压力是50bar的话,是不是就是要先做一下在50bar的压力下,晶格的溶解吸附能力,然后再利用得到的这个含有气体分子的模型,进而模拟扩散过程, ...

对的,就是这样滴
回帖评分哪里可以多次给金币的吧
5楼2014-01-02 15:47:27
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笑笑愁

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-02 10:43:30
zhl1987091: 金币+10, 本来是想给30个金币的,无奈最多只能给10个 2014-01-02 15:34:07
做扩散肯定是要NVT系综的,楼主的三个问题我并在一起回答。
文献里的经常有扩散系数与压力的关系曲线,实际上是先做一定压力下的GCMC,然后把得到的构型跑MD,原来的一定压力就是你扩散MSD对应的压力哦;我们组做了很多这方面的。希望对你有帮助。
3楼2014-01-02 09:38:16
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zhl1987091

木虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-01-02 09:38:16
做扩散肯定是要NVT系综的,楼主的三个问题我并在一起回答。
文献里的经常有扩散系数与压力的关系曲线,实际上是先做一定压力下的GCMC,然后把得到的构型跑MD,原来的一定压力就是你扩散MSD对应的压力哦;我们组做了 ...

在前面做吸附溶解模拟的过程中有用到这个GCMC,比如说我做扩散要用到的压力是50bar的话,是不是就是要先做一下在50bar的压力下,晶格的溶解吸附能力,然后再利用得到的这个含有气体分子的模型,进而模拟扩散过程,就算是考虑到压力的影响了呢?
4楼2014-01-02 15:33:01
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zhl1987091

木虫 (小有名气)


引用回帖:
5楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-01-02 15:47:27
对的,就是这样滴
回帖评分哪里可以多次给金币的吧...

我先试一下,但是呢,高压下的吸附量是比较大的啊,这样是不是会很费机时,有没有可以取代的方法?(金币好像不能超过10个啊,没关系,如果成功了,我可以买成红花送给你啊)我可能还有后续的问题,还要多多帮助啊!
6楼2014-01-02 16:06:00
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