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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助：lammps非周期边界
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ysshj

金虫 (小有名气)

[交流] 求助：lammps非周期边界 已有6人参与

向大家请教一下，lammps里的非周期边界f,s,m是什么意思？物理意义是什么？手册上只是形象的描述，不算解释吧。
lammps里其他的命令是怎么利用非周期边界条件的？只是用于原子丢失的判定吗？
假如我设置一个很大的盒子，原子只占里面的很小部分，肯定不会丢失，这时f,s,m下是一样的结果吗？
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一个人要像一支队伍。
1楼 2013-12-24 16:50:16
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ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 么么雅 at 2014-01-09 16:30:27
P是周期性边界条件，f就是Fix。固定边界条件，不能透穿，分子碰到弹回，不能泯灭。
s边界可膨胀，可缩小，NPT。
m最小值，不能无限放大或缩小。
P周期性边界条件，不能与其他合用。
如P（x+,x-两个方向都是p）  ...

固定边界条件，分子碰到弹回吗？超出边界就报错跳出了。
m边界：
For example, if the upper z face has a value of 50.0 in the data file, the face will always be positioned at 50.0 or above, even if the maximum z-extent of all the atoms becomes less than 50.0.
可以理解为盒子允许放大，但有设置的最小尺寸吗？

  fs（y—是f，y+是s）

[ Last edited by ysshj on 2014-1-10 at 16:49 ]
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一个人要像一支队伍。
17楼2014-01-09 18:37:29
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ysshj

金虫 (小有名气)
同行们发表下看法吧，否则我这问题显得特没趣，甚至lammps的非周期边界特没趣。
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一个人要像一支队伍。
2楼2013-12-26 10:04:39
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dyc_2008

捐助贵宾 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by ysshj at 2013-12-26 10:04:39
同行们发表下看法吧，否则我这问题显得特没趣，甚至lammps的非周期边界特没趣。

真的很没趣  测测就知道了
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一布福田，二修菩提
3楼2013-12-27 12:48:56
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ysshj

金虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-31 16:21:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by dyc_2008 at 2013-12-27 12:48:56
真的很没趣  测测就知道了...

终于有人回复了，感激涕零。
假如我设置一个很大的盒子，原子只占里面的很小部分，肯定不会丢失，这时f,s,m下是不一样的结果。我给Lammps/Mailing Lists发过信息，得到的回复意思应该是结果会一样。
大家如果用到了非周期边界，应该都考虑过这三种的差别吧。我不想给大家什么暗示，只是想知道下大家的结果如何，最后怎么定的边界。
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一个人要像一支队伍。
4楼2013-12-27 15:46:58
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