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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 7808.3
散金: 100
帖子: 198
在线: 260.9小时
虫号: 990422
注册: 2010-04-06
性别: GG
专业: 林木遗传育种

[求助] 比较转录组学分析问题已有3人参与

现有同一物种同一组织，不同发育阶段的转录组数据，如何进行分析呢？已知几个感兴趣的次生代谢物合成的基因，如何从转录组数据中筛选它们可能的调控基因？望大神们解惑啊！！！

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1楼 2013-12-24 15:17:48

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qinglanzhang

铜虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 219.5
红花: 1
帖子: 34
在线: 16.2小时
虫号: 2927597
注册: 2014-01-12
性别: MM
专业: 植物遗传学

引用回帖:

10楼: Originally posted by wzw04 at 2014-01-14 08:24:05
不太明白，表达模式相似的，基因之间就一定有关联吗？...

基因表达水平随时空变化而变化，这种变化可以称为表达模式。用聚类软件就可以将表达模式相同的基因聚类，比如MeV 。推荐你看一篇文章，虽然是10年的，较老了，但是作为基础学习是很不错的。
Global analysis of gene activity during Arabidopsis seed development and identification of seed-specific transcription factors. （2010，PNAS）