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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

[求助] 真核生物18S,ITS1,5.8S,ITS2,28S分界点 已有1人参与

如题,各位谁知道如何确定以上几个基因的分界点?mRNA内含子有GU,AG规则,rRNA有没有什么规则可循?一直看到NCBI上的很多序列都自己标明了那些区域是ITS等,不知道上传者是怎么确定的。在这里向大家请教。
PS:不要说下载一条已知序列进行比对,这种方法不解决根本问题,尽管常用
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不忘初心,为梦远行。
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

引用回帖:
2楼: Originally posted by holy518125 at 2014-02-11 18:33:59
几乎不可能确定吧,its序列向来变异大,包括长度和碱基异质性。感觉这几种基因边界的确定应该是根据成熟RNA和pre-rRNA序列比对得到的吧!欢迎讨论!

这么久才看到你的回复,真的非常感谢你!看来ITS区不是很好研究。
不忘初心,为梦远行。
3楼2014-08-29 08:52:57
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holy518125

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

几乎不可能确定吧,its序列向来变异大,包括长度和碱基异质性。感觉这几种基因边界的确定应该是根据成熟RNA和pre-rRNA序列比对得到的吧!欢迎讨论!
2楼2014-02-11 18:33:59
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