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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 真核生物18S,ITS1,5.8S,ITS2,28S分界点
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate

[求助] 真核生物18S,ITS1,5.8S,ITS2,28S分界点 已有1人参与

如题，各位谁知道如何确定以上几个基因的分界点？mRNA内含子有GU,AG规则，rRNA有没有什么规则可循？一直看到NCBI上的很多序列都自己标明了那些区域是ITS等，不知道上传者是怎么确定的。在这里向大家请教。
PS：不要说下载一条已知序列进行比对，这种方法不解决根本问题，尽管常用
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不忘初心，为梦远行。
1楼 2013-12-20 16:13:49
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holy518125

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

几乎不可能确定吧，its序列向来变异大，包括长度和碱基异质性。感觉这几种基因边界的确定应该是根据成熟RNA和pre-rRNA序列比对得到的吧！欢迎讨论！
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2楼2014-02-11 18:33:59
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leon198418029

金虫 (小有名气)

research associate
引用回帖:
2楼: Originally posted by holy518125 at 2014-02-11 18:33:59
几乎不可能确定吧，its序列向来变异大，包括长度和碱基异质性。感觉这几种基因边界的确定应该是根据成熟RNA和pre-rRNA序列比对得到的吧！欢迎讨论！

这么久才看到你的回复，真的非常感谢你！看来ITS区不是很好研究。
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不忘初心，为梦远行。
3楼2014-08-29 08:52:57
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