| 查看: 3994 | 回复: 14 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
vividhu木虫 (正式写手)
|
[求助]
diamond画图求助-黑白横纹椭球图 已有4人参与
|
|
|
本人新手一枚，晶体已经解析完了，最近在画图及相关具体数据的分析，其中有几个问题，麻烦大家帮忙看下。 1、我想得到如图1的黑白的横纹椭球图，但是我自己用diamond作图只能得到如图2的彩色的，而且椭球的剖面部分也不是横纹的那种，不知道这个怎么设置啊，求帮助啊。  图1  图2 2、关于分子内氢键和分子间氢键的，以下是我用planton计算得到的共11个氢键，这些氢键都对吗，都需要找出来吗？ Nr Typ Res Donor-- H....Acceptor [ ARU ] D - H H...A D...A D - H...A A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ) Sum(XZ) ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1 Intra 2 N(1) --H(1) ..O(3) [ ] 0.89(3) 2.06(3) 2.778(3) 138(2) 2 2 N(1) --H(1) ..O(6) [ 2666.01] 0.89(3) 2.50(3) 3.233(3) 141(2)' 80.3(11)' 359(3) 3 2 N(2) --H(2) ..O(6) [ 1565.01] 0.88(3) 2.25(3) 3.088(3) 158(3) 4 Intra 1 N(3) --H(3) ..O(6) [ ] 0.89(2) 2.16(2) 2.825(3) 131.3(18) 5 1 N(3) --H(3) ..O(3) [ 2666.02] 0.89(2) 2.33(2) 3.110(3) 146.4(19)' 82.3(8)' 360(3) 6 1 N(4) --H(4) ..O(6) [ 2756.01] 0.92(2) 2.29(2) 3.188(3) 165.8(18) 7 Intra 2 C(6) --H(6B) ..O(2) [ ] 0.96 2.43 3.015(4) 119 8 Intra 2 C(6) --H(6C) ..N(2) [ ] 0.96 2.42 2.790(4) 102 9 2 C(11) --H(11) ..O(2) [ 1556.02] 0.93 2.55 3.476(4) 171 10 Intra 1 C(18) --H(18A) ..N(4) [ ] 0.96 2.31 2.768(3) 108 11 Intra 1 C(18) --H(18B) ..O(5) [ ] 0.96 2.59 2.997(4) 106 Translation of ARU-Code to CIF and Equivalent Position Code =========================================================== [ 2666.] = [ 2_666] =1-x,1-y,1-z [ 2756.] = [ 2_756] =2-x,-y,1-z [ 1565.] = [ 1_565] =x,1+y,z [ 1556.] = [ 1_556] =x,y,1+z [ Last edited by vividhu on 2013-12-18 at 10:01 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
在MOF中，有没有羧基参加配位的情况
已经有2人回复
-
招2026年入学上海交通大学博士生，急！！！
已经有1人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有137人回复
-
理论计算合作
已经有0人回复
-
求高校合作
已经有1人回复
-
27级无机化学申博自荐
已经有2人回复
-
Chemdraw免费软件
已经有0人回复
-
单晶结构解析，各类疑难晶体数据处理和答疑
已经有38人回复
-
这个水相反应有没有催化剂促进发生
已经有4人回复
-
Mn Me3TACN
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样用diamond画这种椭球图，主要是不太会设置
已经有10人回复
wbulu
至尊木虫 (小有名气)
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 13576.3
- 散金: 10
- 红花: 4
- 帖子: 145
- 在线: 548.9小时
- 虫号: 181006
- 注册: 2006-02-10
- 专业: 无机合成和制备化学
5楼2013-12-18 23:48:46
forever1706
禁虫 (知名作家)
- 应助: 153 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 12411
- 散金: 2934
- 红花: 49
- 帖子: 7486
- 在线: 1066.6小时
- 虫号: 593939
- 注册: 2008-09-06
- 性别: GG
- 专业: 物理化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
vividhu: 金币+3, ★有帮助, shelxtl是指用xp画的吗？可是xp好像不能画出其中的分子内氢键啊。 2013-12-18 14:21:22
感谢参与，应助指数 +1
vividhu: 金币+3, ★有帮助, shelxtl是指用xp画的吗？可是xp好像不能画出其中的分子内氢键啊。 2013-12-18 14:21:22
|
目测图1是shelxtl画的，如果非要这个样子的图，建议用shelxtl。用Diamond的选项更丰富，非要改成这个样子也得折腾一阵，还不一定完全一样。picture--atom design, 改原子；picture--bond design，改键；picture--layout，改背景。。。多试试就知道了。 氢键1-6是NH-O氢键，属经典氢键。是否合理得看结构解析是否正确合理。 其余是非经典氢键，比较弱，不知道你是否要讨论，如果不是要讨论的对象，直接忽略吧。 |
2楼2013-12-18 10:35:34
vividhu
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2902.7
- 散金: 674
- 红花: 2
- 帖子: 334
- 在线: 89.9小时
- 虫号: 1188463
- 注册: 2011-01-12
- 性别: MM
- 专业: 有机合成
3楼2013-12-18 14:24:21
4楼2013-12-18 19:43:25
28