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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 几何优化已经一个多礼拜了，一步都没走这是什么情况啊
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xzy401633

金虫 (小有名气)
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7楼: Originally posted by franch at 2013-12-16 22:10:27
很简单。。。。。  常见的现象。。   体系太大了，，，，

体系确实大些。但是跑不动不应该是这一个原因吧，一个多礼拜了
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11楼2013-12-17 09:40:38
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xzy401633

金虫 (小有名气)
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8楼: Originally posted by zmrright at 2013-12-16 23:57:38
这个估计不行了，你还是改改参数，体系再试！

体系的参数是ICSD上的unit cell参数。可以转为premitive cell 来算么
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12楼2013-12-17 09:41:38
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xzy401633

金虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by sunboyccc at 2013-12-17 07:39:30
占用16G内存的任务算一周了，都没跑动，估计有点问题，不一定是体系大一个原因，要是体系太大，你的内存就不允许算了；
    另外，是不是调用虚拟内存了，此时机器会超慢！时间都花在不停地、来回导数据。算任务时 ...

就开始阶段占用的少，后面直接就是8,90了
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13楼2013-12-17 09:42:52
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xzy401633

金虫 (小有名气)
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10楼: Originally posted by ghostsprite at 2013-12-17 08:41:45
1，网络问题
2，体系建立不对（这个会报错）
3，我有次内存用的很多，但是cpu使用率很低，这就是没算。建议重启

网络应该不会有问题， 体系也是正确的吧，数据都是ICSD里查的。我重算试试吧，
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14楼2013-12-17 09:43:56
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ghostsprite

金虫 (小有名气)
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14楼: Originally posted by xzy401633 at 2013-12-17 09:43:56
网络应该不会有问题， 体系也是正确的吧，数据都是ICSD里查的。我重算试试吧，...

反正我现在为了保险，每次运行ms时都会开启windows任务管理器选定性能然后最小化。要是cpu利用率长时间没有到达90%以上，便的设法重算~
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不能实现理想的人都有一个共通之处，那就是像要一样东西，却怎么也不愿为之付出！
15楼2013-12-17 13:54:00
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xzy401633

金虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by ghostsprite at 2013-12-17 13:54:00
反正我现在为了保险，每次运行ms时都会开启windows任务管理器选定性能然后最小化。要是cpu利用率长时间没有到达90%以上，便的设法重算~...

我也试试
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16楼2013-12-17 14:48:41
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
如果体系较大，内存的量会不足，于是积分不是直接在内存调取，而是将内存中的积分先存储到硬盘上，写硬盘的时候cpu的效率很差。你的情况应该就是狂写硬盘的情况。winodws的似乎计算的时候内存分配和linux不同，似乎这个问题更严重。

另外，不知你怎样定义体系大小。前面的人说的remote view不知道你打开来看是不是因为不收敛造成，如果不是，那么就真的和计算方法有关。比如采用杂化泛函，必须执行Allbands/EDFT以及模守恒赝势，很小的体系代价也十分昂贵。我师兄用HSE06算了个硫化锌原胞（2原子）的SP用8核的服务器还折腾大半天。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
17楼2013-12-18 14:16:17
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xzy401633

金虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-12-18 14:16:17
如果体系较大，内存的量会不足，于是积分不是直接在内存调取，而是将内存中的积分先存储到硬盘上，写硬盘的时候cpu的效率很差。你的情况应该就是狂写硬盘的情况。winodws的似乎计算的时候内存分配和linux不同，似乎 ...

打开remote view 新手看不懂呢。求教一下
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学习
18楼2013-12-18 14:40:01
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
18楼: Originally posted by xzy401633 at 2013-12-18 14:40:01
打开remote view 新手看不懂呢。求教一下...

看迭代是否振荡，不知道你的scf maxcycle=???如果小于150，并且没有报错，那么一周下来一点动静都没有就是算不动了。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
19楼2013-12-18 15:13:22
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xzy401633

金虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-12-18 15:13:22
看迭代是否振荡，不知道你的scf maxcycle=???如果小于150，并且没有报错，那么一周下来一点动静都没有就是算不动了。...

我打开remote view 是一个网页啊。网页里面的内容是这样的额
Index of /dsd/jobs/APVTF

Name                    Last modified      Size  Description
Parent Directory                             -   
04028.pid               18-Dec-2013 16:07   11   
C_00PBE.usp             18-Dec-2013 16:07  328K  
Castepexe.log           18-Dec-2013 16:07    0   
Fe3C.castep             18-Dec-2013 16:07  115   
Fe3C.cell               18-Dec-2013 16:07  4.1K  
Fe3C.param              18-Dec-2013 16:07  915   
Fe_00PBE.uspcc          18-Dec-2013 16:07  391K  
core                    18-Dec-2013 16:07    0   
fromdsd.txt             18-Dec-2013 16:07  175   
jobident.txt            18-Dec-2013 16:06   87   
perlrunner.bat          18-Dec-2013 16:07  1.2K  
std_err.txt             18-Dec-2013 16:07    0   
std_out.txt             18-Dec-2013 16:07    0   
tmp/                    18-Dec-2013 16:07    -   
todsd.txt               18-Dec-2013 16:07  117   
Apache/2.2.22 (Win64) mod_perl/2.0.4 Perl/v5.8.9 Server at jay-pc Port 80
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学习
20楼2013-12-18 16:08:54
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