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李晓绒

新虫 (小有名气)

[求助] 结构的比较 已有3人参与

求助，同一个结构用不同的方法优化，优化后的结构怎么比较好坏，用RMSD么？这个RMSD是怎么算的？非常感谢大家帮助！
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1楼 2013-12-16 09:28:49
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 李晓绒 at 2013-12-16 16:41:56
能量有实验数据可以做比较，可键长没找见实验数据，没法与实验值比较，那怎么就能说明哪种方法优化的结构好呢？...

这个要根据其他文献，并结合你研究的体系来看了，可以算下频率看看几个特征峰和实验吻合的情况。
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5楼2013-12-16 17:13:11
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-12-16 21:56:47
比较能量变化，并结合实验数据判断
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2楼2013-12-16 11:16:59
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-12-16 17:49:59
首先比较能量，能量越低越稳定

分子构型参数，键长键角等与实验值的比较
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3楼2013-12-16 15:24:45
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李晓绒

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-12-16 11:16:59
比较能量变化，并结合实验数据判断

能量有实验数据可以做比较，可键长没找见实验数据，没法与实验值比较，那怎么就能说明哪种方法优化的结构好呢？
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4楼2013-12-16 16:41:56
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