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李晓绒

新虫 (小有名气)

[求助] 结构的比较 已有3人参与

求助,同一个结构用不同的方法优化,优化后的结构怎么比较好坏,用RMSD么?这个RMSD是怎么算的?非常感谢大家帮助!
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-12-16 21:56:47
比较能量变化,并结合实验数据判断
2楼2013-12-16 11:16:59
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-12-16 17:49:59
首先比较能量,能量越低越稳定

分子构型参数,键长键角等与实验值的比较
3楼2013-12-16 15:24:45
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李晓绒

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-12-16 11:16:59
比较能量变化,并结合实验数据判断

能量有实验数据可以做比较,可键长没找见实验数据,没法与实验值比较,那怎么就能说明哪种方法优化的结构好呢?
4楼2013-12-16 16:41:56
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 李晓绒 at 2013-12-16 16:41:56
能量有实验数据可以做比较,可键长没找见实验数据,没法与实验值比较,那怎么就能说明哪种方法优化的结构好呢?...

这个要根据其他文献,并结合你研究的体系来看了,可以算下频率看看几个特征峰和实验吻合的情况。
5楼2013-12-16 17:13:11
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李晓绒

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-12-16 17:13:11
这个要根据其他文献,并结合你研究的体系来看了,可以算下频率看看几个特征峰和实验吻合的情况。...

我看了一篇文献,上面是说用CCSD水平下的结构作为标准的,其他方法优化下的结构与之比较来看好坏,用到RMSD,我也想这样比较,但不知RMSD怎么算
6楼2013-12-16 17:32:33
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李晓绒

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-12-16 11:16:59
比较能量变化,并结合实验数据判断

谢谢帮助!
7楼2013-12-16 17:33:38
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山羊2b

禁虫 (初入文坛)


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-12-16 21:58:24
本帖内容被屏蔽

8楼2013-12-16 18:26:58
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