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deanxiao

木虫 (著名写手)
支持哈，我导师不搞计算机
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61楼2008-01-01 10:28:42
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luai071

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+5,VIP+0):新年快乐！
【老师/博士姓名】陈凯先
【研究方向】计算机辅助药物分子设计
【使用程序/方法】
【所在单位】中国科学院上海药物研究所、上海中医药大学
【联系方式】
【单位&个人主页】http://www.simm.ac.cn/p3_01_07.htm
【简介】1967年毕业于复旦大学物理二系放射化学专业。1978年9月考取中国科学院上海药物研究所研究生，1985年获博士学位。1985-1988年在巴黎生物物理化学研究所进行博士后研究。中国科学院上海药物研究所研究员、博士生导师，所长。1999年当选为中国科学院院士。现任国家新药研究和开发专家委员会委员、中国科学院新药研究专家委员会委员、中国新医药博士联谊会理事长；中国药学会、上海市药学会、上海市分子科学研究会理事；中国药理学报、物理化学学报、中国医药工业杂志、分子科学学报、药学进展、药物化学杂志编委；被聘为浙江大学、上海交通大学、上海医科大学、中国药科大学、第二军医大学兼职教授。　

他主要从事计算机辅助药物分子设计研究。进行有机小分子和生物大分子的结构和生物活性之间关系的研究，有活性的有机小分子结构预测和设计。提出了计算机药物和受体疏水作用力场三维分布的数学模型和药物构象研究的方法，发展了药效基团的搜寻方法，建立了利用计算机构建具有结构多样性的分子库和模拟筛选的方法，并应用于多种抗肿瘤药物与核酸相互作用的研究。开发了基于药物与受体三维结构的药物设计研究，其中一些受体三维结构模型和新药的分子设计得到了实验的验证。

他发表论文70余篇。其中关于大分子的量子化学从头不计算方法和技术的研究成果，获得中国科学院科技进步二等奖（1986）；关于柔红霉素与DNA相互作用的研究成果，获1986年度尼纳·舒可伦奖（法国）；基于蛋白质和核酸三维结构的药物分子设计的研究成果，获中国科学院自然科学二等奖（1997）；此外，还曾获中国药学会青年科技奖等奖励。1991年被国务院学位委员会授予“有突出贡献的中国博士学位获得者”称号，1994年被中国科学院评为“有突出贡献的中青年专家”。1997年被评为上海市“十大科技精英”。

【科研代表作】
1．创新药物研究的现代理论与方法

   攀登计划预选项目，项目主持人

   计算机辅助药物分子设计的若干方法与应用研究

   攀登计划预选项目子项目，项目负责人

   2．基于AchE三维结构的药物设计

   “863"项目，项目负责人

   3．新型乙酰胆碱酯酶抑制剂的药物分子设计研究

   国家自然科学基金项目，项目负责人

   4．基于生物大分子和配体相互作用的药物分子设计
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62楼2008-01-01 16:10:05
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liucheng883

木虫之王 (文坛精英)
★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+4,VIP+0):新年快乐！
【老师/博士姓名】王宝山
【研究方向】理论与计算化学
【使用程序/方法】
【所在单位】武汉大学化学与分子科学学院
【联系方式】Email: wangb@chem.whu.edu.cn
                 Tel： 027-68756347 Fax：027-68754067
【单位&个人主页】http://www.chem.whu.edu.cn/szdw_show.aspx?id=1433
【简介】基本简历及科研介绍
简历：

1990年至2000年获山东大学化学学士、硕士、博士。2000年至2003年在美国Brookhaven National Laboratory 和Argonne National Laboratory做博士后研究（Postdoctoral Research Associate）。2004年至今武汉大学化学与分子科学学院任教。已在理论和计算化学领域发表学术论文30多篇。

研究方向简介（Research Projects）

This laboratory is interested in both quantum mechanics and molecular mechanics. The major interest is to discover new chemistry in the filed of atmosphere, combustion, solution, materials, and biomolecules. Molecule geometries(bond structures, crystal phase, solvation structures), electronic properties (tensors, diople, polarization, hyperpolarization, charges, orbitals), spectral properties (UV, infrared, raman, NMR, CD, band structure, DOS), and reactions (mechanism, kinetics, dynamics) can be predicted theoretically with a high accuracy.

Theoretically, the efficient semi-empirical quantum chemistry methods have been developed to estimate the thermo-chemical data for gas, liquid, and solid. The specific property parameterized density functional theory has been developed for the simulation of chemical reaction and for the prediction of the chemical properties such as NMR chemical shifts.

The software we developed includes:

HEDM: a fast calculator for the high energetic density materials

    DiDyn: a quasi-classical trajectory simulation software using on-the-fly ab initio methods for MD

WinDFTB: a semi-empirical tight-binding program running on windows platform.

RRKM-TST: a program to calculate the T, P-dependent kinetics for complex reactions.

Computationally, we use various quantum chemistry and molecular mechanic softwares to investigate the following chemical problems:

(1) The chemistry in solution.

         Electronic structures of the solvated molecules, depending on the temperature, the concentration, the pH, etc. can be simulated using first principle method. The solvated structure, IR/Raman spectra, diffusion, coordination number, and hydrogen-bond lifetime can be obtained theoretically.

         The chemical reactions in solution is simulated using meta-dynamics.

         CPMD is the key software. VMD and JMOL for visualization.

(2) The interaction between small molecules and macromolecules

         Using hybrid QM/MM methods, the interaction energy between the small molecules (guest) and the macromolecules (host) is calculated. The study is extremely useful for molecular design.

         Softwares: Gaussian03, DFTB, Mopac, Amber, BOSS, Gromos, Gaussview

(3) Mechanism and kinetics of the complex chemical reactions

         We are able to characterize the detailed reaction pathways by exploring the potential energy surface and the corresponding kinetic information such as rate coefficient and branching ratios for each product channel can be obtained straightforwardly. Besides the gas-phase reactions of interest in atmosphere and combustion, the solvent effect and the confined environments such as nanotubes can be simulated using various solvation models and QM/MM methods, respectively.

         Software: Gaussian03, Molpro, RRKM-TST, Variflex, Polyrate

(4) Material simulation and surface reactions

         This study is to discover the properties of the bulk materials at different conditions. The catalysis reaction mechanism can be obtained by simulation of the chemical reactions on the surfaces.

         Software: MaterialsStudio (DMol, CASTEP, Discover)

(5) The other topics of our interest include: structure-activity relationship, electronic excited state, radical complexes.

实验室硬件设备：

AMD Opteron computers, SGI origin350, PC cluster.

科研项目：

全国优秀博士论文作者专项基金

湖北省青年杰出人才基金

留学回国科研启动基金

国家自然科学基金面上项目

新世纪优秀人才支持计划项目

国防973课题

教学：

本科生：结构化学、物理化学（国家精品课程）

研究生：应用量子化学（武汉大学精品课程）

结构化学实验 (Chem3D with Games and Mopac)

学术论文：

1. "Ab initio study of the reaction of propionyl (C2H5CO) radical with oxygen (O2)", Hua Hou and Baoshan Wang, J. Chem. Phys. 2007, 127, 054306.

2. “Computational study of the reaction of atomic oxygen with acetone in thegas phase”, Hua Hou; Y. Li; Baoshan Wang, J. Phys. Chem. A. 2006, 110, 13163.

3. “Hydrolytically stable tricoordinate chiral bicyclo[4.4.0]diboronic ester: synthesis, structural characterization, and theoretical Investigation”, Yan Zhou, Zixing Shan, Baoshan Wang, and Peng Xie, Organometallics 2006, 25, 4917.

4. “Ab initio study of the potential energy surface for the OH+CO --> H+CO2 reaction”, Xinli Song, Jicun Li, Hua Hou, and Baoshan Wang, J. Chem. Phys. 2006, 125, 094301.

5. “Computational study of the reaction of chlorinated vinyl radical with molecular oxygen (C2Cl3 + O2)”, Huan Wang, Jicun Li, Xinli Song, Yuzhen Li, Hua Hou, Baoshan Wang, Hongmei Su, and Fanao Kong, J. Phys. Chem. A 2006, 110, 10336.

6. “A systematic computational study of the reactions of HO2 with RO2: the HO2 + C2H5O2 reaction”, Hua Hou, Jicun Li, Xinli Song, and Baoshan Wang,* J. Phys. Chem. A 2005, 109, 11206.

7. “Mechanistic and kinetic study of the O + CH3OCH2 reaction and the unimolecular decomposition of CH3OCH2O”, Xinli Song, Hua Hou and Baoshan Wang,* Phys . Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 3980
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63楼2008-01-01 19:03:46
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chongzi728

金虫 (小有名气)

黎书华－南京大学理论与计算化学研究所副所长兼理论材料化学研究室主任、教授

★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+4,VIP+0):新年快乐！
【老师/博士姓名】黎书华
【研究方向】黎书华教授的研究领域包括线性标度的量子化学计算方法，多参考态电子相关方法，无机及有机金属反应的理论研究等。
【使用程序/方法】Gaussian，MS，以及组内自己开发的计算软件等
【所在单位】南京大学化学化工学院
【联系方式】
理论与计算化学研究所
江苏省南京市汉口路22#
邮编: 210093
电话: 025-83686465
传真: 025-83686553
Email: shuhua@nju.edu.cn
实验室: 蒙民伟楼702室
【单位&个人主页】http://itcc.nju.edu.cn/itcc/shuhua/index.html
【简介】基本简历及科研介绍

1969年7月生,湖南人。1990年在中南工业大学化学系本科毕业。1996年毕业于南京大学化学化工学院，获理学博士学位。随后,在南京大学物理系(1996-1998)、美国Texas A&M大学化学系(1998-2000)从事博士后研究。2000年-2002年任南京大学化学化工学院副教授。2002年起任南京大学化学化工学院教授、博士生导师。迄今为止,已主持了三项国家自然科学面上(含青年)基金，一项科技部973课题,并参与了一项国家自然科学基金重点项目。

2006年 国家杰出青年科学基金资助
2004年 教育部“新世纪优秀人才支持计划”资助
2004年 第九届霍英东教育基金会高等院校青年教师基金资助
2002年 中国化学会青年化学奖


国家杰出青年科学基金项目 (2007.1-2010.12)
多参考态电子相关新方法及应用 [项目负责人]
国家自然科学基金项目 (2004-2006)
第九届霍英东教育基金会高等院校青年教师基金项目 (2004-2006)
光化学反应的基础理论研究  [主要参与人]
国家自然科学基金重点项目 (2003.1-2006.12)


Hao Dong, Weijie Hua, and Shuhua Li*
Estimation on the Individual Hydrogen-Bond Strength in Molecules with Multiple Hydrogen Bonds
J. Phys. Chem. A 111, 2941-2945 (2007).

Wei Li, Shuhua Li*, and Yuansheng Jiang
Generalized Energy-Based Fragmentation Approach for Computing the Ground-State Energies and Properties of Large Molecules
J. Phys. Chem. A 111, 2193-2199 (2007).

Hui Chen and Shuhua Li*
CASPT2//CASSCF Study on the Photolysis Mechanism of 2,3-Diazabicyclo[2.1.1]hex-2-ene: C-N versus C-C Cleavage
J. Org. Chem. 71, 9013-9022 (2006).

Hui Chen and Shuhua Li*
Theoretical Study on the Excitation Energies of Six Tautomers of Guanine: Evidence for the Assignment of the Rare Tautomers
J. Phys. Chem. A 110, 12360-12362 (2006).

Jianyi Wang and Shuhua Li*
Theoretical Study Toward Understanding the Catalytic Mechanism of Pyruvate Dehydrogenase Multienzyme Complex E1 Component
J. Theor. Comput. Chem. 5, 447-459 (2006).

Zongxin Pi and Shuhua Li*
Theoretical Study on the Diels-Alder Reaction between 2-Methylacrolein and Cyclopentadiene Catalyzed by a Cationic Oxazaborolidine Lewis Acid
J. Phys. Chem. A 110(29), 9225-9230 (2006).

Shuhua Li*, Jun Shen, Wei Li, and Yuansheng Jiang,
An efficient implementation of the "cluster-in- molecule" approach for local electron correlation calculations.
J. Chem. Phys. 125, 074109 (2006).

Hui Chen and Shuhua Li*
Ab initio study on deactivation pathways of excited 9H-guanine
J. Chem. Phys. 124, 154315 (2006).

Wei Li, Tao Fang, and Shuhua Li*
A fragment energy assembler method for Hartree-Fock calculations of large molecules
J. Chem. Phys. 124, 154102 (2006).

Jianyi Wang and Shuhua Li*
Catalytic Mechanism of 6-Phosphogluconate Dehydrogenase: A Theoretical Investigation
J. Phys. Chem. B. 110, 7029-7035 (2006).

Xin Wang, Shuhua Li*, and Yansheng Jiang
A Theoretical Study of the Mechanism of Phosphine-Catalyzed Hydroalkoxylation of Methyl Vinyl Ketone
J. Phys. Chem. A. 109, 10770-10775 (2005).

Jianyi Wang, Hao Dong, Shuhua Li*, and Hongwu He
Theoretical Study toward Understanding the Catalytic Mechanism of Pyruvate Decarboxylase
J. Phys. Chem. B. 109, 18664-18672 (2005).

Hui Chen and Shuhua Li*,
Theoretical Study on the Photolysis Mechanism of 2,3-Diazabicyclo[2.2.2]oct-2-ene
J. Am. Chem. Soc. 127, 13190-13199 (2005).

Hui Chen and Shuhua Li*
Theoretical Study toward Understanding Ultrafast Internal Conversion of Excited 9H-Adenine
J. Phys. Chem. A 109, 8443-8446 (2005).

Shuhua Li*, Wei Li, and Tao Fang,
An Efficient Fragment-Based Approach for Predicting the Ground-State Energies and Structures of Large Molecules
J. Am. Chem. Soc. 127, 7215-7226 (2005).

Wei Li and Shuhua Li*
A localized molecular-orbital assembler approach for Hartree–Fock calculations of large molecules
J. Chem. Phys. 122, 194109 (2005).

Hui Chen and Shuhua Li*
Mechanism of ruthenium-catalyzed Alder ene-type reaction: A theoretical study
Organometallics 24 (5): 872-884 FEB 28 2005.

Wei Li, Shuhua Li*
Divide-and-conquer local correlation approach to the correlation energy of large molecules
J. Chem. Phys. 2004, 121(14), 6649-6657.

Xin Wang, Shuhua Li*, and Yuansheng Jiang,
Mechanism of H2O2 Dismutation Catalyzed by a New Catalase Mimic (a Non-Heme Dibenzotetraaza[14]annulene-Fe(III) Complex): A Density Functional Theory Investigation
Inorg. Chem. 43(20), 6479-6489 2004.

Ganbing Zhang, Shuhua Li*, and Yuansheng Jiang
Density Functional Study on the Mechanisms of the Reactions of Gas-Phase OsOn+ (n=1-4) with Methane
Organometallics，2004，23(15)，3656-3667.

Shuhua Li
Block-correlated coupled cluster theory: The general formulation and its application to the antiferromagnetic Heisenberg model
J. Chem. Phys. 2004, 120(11), 5017-5026.

Book chapters

Valence Bond Calculations and Their Applications to Medium-sized Hydrocarbons,(In Valence Bond Theory，Ed. By D. L. Cooper)
Yuansheng Jiang, Shuhua Li,Elsevier, 2002.

Software Packages

Shuhua Li*, Wei Li, Tao Fang, Jing Ma, and Yuansheng Jiang, Lower Scaling Quantum Chemistry Program (LSQC), Version 1.0, Nanjing University, Nanjing, April 20, 2006.
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http://bbs.nju.edu.cn/file/BNGames/119918696311989817711.jpg
64楼2008-01-01 22:34:08
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nature522

木虫 (著名写手)

王者天蝎
★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+4,VIP+0):新年快乐！
【老师/博士姓名】刘大有
【研究方向】主要研究知识工程与专家系统，多Agent系统、移动Agent系统与智能Agent，时空表示与推理，粗糙集、格机与数据挖掘，数据结构与算法。
【使用程序】
【所在单位】吉林大学
【联系方式】
【单位&个人主页】
【简介】男，1942年7月生，1981年获硕士学位，教授，1993年被评为博士导师，现任吉林大学软件学院院长。兼任国务院学位委员会学科评议组成员，中国计算机学会理事，吉林省计算机学会理事长，中国计算机学会人工智能与模式识别专委会副主任，中国人工智能学会知识工程专委会副主任。主要研究知识工程与专家系统，多Agent系统、移动Agent系统与智能Agent，时空表示与推理，粗糙集、格机与数据挖掘，数据结构与算法。作为项目负责人承担了近40个国家和省部级项目，其中国家863高技术项目和国家基金项目20项。发表论文200余篇，被三大检索收录100余篇次。出版专著2部，教材4部。获国家科技进步三等奖1项，省部级科技进步一等奖2项、二等奖3项、三等奖2项，长春市科技进步一等奖1项。获省优秀教学成果一等奖1项、国家教委高校优秀教材二等奖1项，国家优秀精品课程1项。
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宠辱不惊,看庭前花开花落;去留无意,望天上云卷云舒.
65楼2008-01-01 23:05:44
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忘了时间的钟

木虫 (著名写手)

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66楼2008-01-02 10:11:39
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xtzhzh

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
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【老师/博士姓名】曾凡桂 教授
【研究方向】煤化学：主要是煤分子工程与煤分子地球化学研究，另外还有矿物物理化学、环境地球化学
【使用程序】经典的Cerius、Gussian；
【所在单位】太原理工大学地球科学与工程系
【联系方式】zengfangui@tyut.edu.cn
【单位&个人主页】暂无
【简介】曾凡桂： 太原理工大学矿业工程学院矿产普查与勘探学术带头人 博士 教授 1965年12月生，1991年 西安矿业学院，获硕士学位 1996年 中国矿业大学北京研究生部 获博士学位。长期从事洁净煤技术的基础课题－煤资源的特性及其与其洁净利用技术的适应性评价研究工作，先后主持和完成了"国家973"、国家自然科学基金、省部级和企业委托项目20余项，获省部级科技进步奖3项，出版教材专著2部，发表论文40余篇。将分形理论与方法引入煤的粉碎及煤结构的研究中，建立了煤粉碎机理研究的煤岩学及分形理论研究方法，较为准确的预测煤粉碎过程中粒度的分布特征；通过对煤化作用过程中煤大分子结构特征演化的研究，建立了系统的煤化作用化学机制的理论模拟方法，揭示煤结构特征与其物理化学性质关系的关键是建立先进的煤结构化学概念；提出通过煤超分子结构的研究可以实现洁净煤技术的源头创新。
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67楼2008-01-02 11:13:27
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fr211fr

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
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【老师/博士姓名】赵存元 教授
【研究方向】主要从事催化反应机理及团簇材料分子设计方面的理论研究，在《J. Am. Chem. Soc.》、《 J. Phy. Chem.A》、《 J. Chem. Phys.》、《Organometallics》、《J. Org. Chem.》、《Inorg. Chem.》、《Chem. Eur. J. 》等重要刊物发表论文40多篇
【使用程序】经典的Gussian；
【所在单位】中山大学化学与化学工程学院，教授；博士生导师
【联系方式】ceszhcy@mail.sysu.edu.cn
【单位&个人主页】暂无
教育背景：
　　1997年11月毕业于南京大学配位化学研究所，理论无机化学专业，获理学博士学位。
　　1987年7月毕业于西北师范大学化学化工学院，物理化学专业，获理学硕士学位。
　　1984年7月毕业于西北师范大学化学化工学院，获理学学士学位。
工作简历：
　　2004.09 -  至今：中山大学化学与化学工程学院，教授；博士生导师。
　　2002.02-2004.09：香港大学化学系，博士后。
　　2000.09-2002.02：美国戴维斯加州大学，博士后。
　　1999.09-2000.09：香港科技大学化学系，博士后。
　　1996.12-1999.09：西北师范大学化学化工学院，副教授。
　　1987.07-1996.12：西北师范大学化学化工学院，助教、讲师。
主要研究方向：
　　1. 金属类卡宾化合物、金属氮宾的反应性能、环丙烷化反应及其不对称催化选择性机理的理论研究。
　　2. 金属团簇及团簇离子的基态和激发态的电子结构、性能及金属团簇光电磁等物理化学性质的分子设计研究。
　　3. 卤代烃在水溶液中的光化学反应机理的理论研究。
　　4. 有机张力分子的张力评价及化学键的理论研究。
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68楼2008-01-02 15:29:37
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chongzi728

金虫 (小有名气)

东北师范大学教授博导——张景萍教授

★ ★ ★ ★ ★
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东北师范大学教授博导——张景萍教授

【老师/博士姓名】张景萍
【研究方向】
（1）光电磁功能材料及化学传感器的分子设计与性能研究。
（2）多功能有机分子筛材料的设计与性能研究。
（3）FET与有机太阳能电池材料的分子设计。
【使用程序/方法】
Gaussian等计算程序
【所在单位】东北师范大学化学学院
【联系方式】
办公电话  85099372
E-mail  zhangjp162@nenu.edu.
【单位&个人主页】
http://www.nenu.edu.cn/professor/pro/show.php?flag=1&id=59
【简介】基本简历及科研介绍
张景萍，博士、教授，博导，《分子科学学报》编辑部主任, 吉林大学化学学院兼职教授，长春市政协委员。先后在德国马普高分子研究所、美国麻省大学、日本九州大学等地从事合作研究与博士后工作。主要从事分子磁性材料、电致发光材料、有机沸石与化学传感器的基础研究。曾主持或完成国家自然科学基金、国家教育部重大项目、霍英东青年基金、吉林省杰出青年基金项目等10项，目前正在主持承担教育部新世纪优秀人才支持计划和两项国家自然科学基金项目。至今累计在国内外学术刊物上发表学术论文100余篇，其中被SCI收录60余篇。
　　从事化学学院、博士、硕士研究生及本科生的教学工作，主要讲授的博士生课程：分子磁学；硕士研究生课程: 高等物理化学实验、电子结构与化学（英文原版教材）、功能材料（磁性材料）。本科生课程：分析化学、化学与社会、仪器分析实验。
　　指导博士研究生9名，其中外国留学生3名，指导硕士研究生 16名，其中外国留学生1名。
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http://bbs.nju.edu.cn/file/BNGames/119918696311989817711.jpg
69楼2008-01-02 20:20:57
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xxman1984

木虫 (正式写手)

笑催人
★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):thanks 化学活动周发帖有奖~
【老师/博士姓名】李俊篯
【研究方向】量子化学
【使用程序】
【所在单位】福州大学
【联系方式】
【单位&个人主页】www.fzu.edu.cn
【简介】基本简历及科研介绍
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事是做出来的，没做就知道失败，那就是真正的失败
70楼2008-01-02 20:42:46
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