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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-14 08:57:41
引用回帖:
8楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-13 17:31:38
你好
想请问一下有哪些力场涉及到炔烃?
也就是含有碳三键的?
我目前要计算的体系里含有乙炔,但是它的力场一直没有选好,现在想着自己用TraPPE力场的格式编写。
若已经有炔烃的力场,那我就省了很多功夫了。 ...

有机分子可以考虑pcff和dreiding
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
11楼2013-12-13 18:55:03
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hexingyi

木虫 (职业作家)



月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-14 08:57:53
好像是build里面有个calculate功能,自动计算单键还是双键,很好用
分子结构最好用单晶里的数据,可以用相似的分子改动一下得到自己需要的结构
12楼2013-12-13 19:01:25
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gx730

金虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-13 18:55:03
有机分子可以考虑pcff和dreiding...

那这两个力场能和TraPPE力场混合使用?
我是在用towhee模拟气液相平衡,已经做完单组份的了,现在体系中增加了乙炔。
13楼2013-12-13 19:57:21
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-14 08:58:01
引用回帖:
13楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-13 19:57:21
那这两个力场能和TraPPE力场混合使用?
我是在用towhee模拟气液相平衡,已经做完单组份的了,现在体系中增加了乙炔。...

我还以为你在ms里面做计算呢…towhee里的力场我不熟…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
14楼2013-12-13 20:26:49
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gx730

金虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-13 20:26:49
我还以为你在ms里面做计算呢…towhee里的力场我不熟…
...

还是谢谢你的回复。
我刚才又查了towhee的教程,dreiding力场是可以和TraPPE力场混合使用,都是L-J力场。
15楼2013-12-13 21:10:10
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
15楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-13 21:10:10
还是谢谢你的回复。
我刚才又查了towhee的教程,dreiding力场是可以和TraPPE力场混合使用,都是L-J力场。...

厉害
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
16楼2013-12-13 21:53:00
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Voland

金虫 (小有名气)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-14 08:58:20
如果你做的是分子力场方法,必须考虑的说,因为这样才能对原子类型进行合适的匹配。
如果你做的是量子化学方法,不需要考虑的说,因为薛定谔方程求解只和原子坐标有关系,与键怎么表示毫无关系。
Yağma!Yağma!Yağma!
17楼2013-12-14 00:09:08
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