应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS中怎对体系进行单轴压缩
101/1返回列表
查看: 2759  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

韩欢欢

金虫 (初入文坛)

[求助] LAMMPS中怎对体系进行单轴压缩 已有1人参与

LAMMPS中怎么对体系进行单轴压缩，是以一定的应变率进行压缩的，请教下在lammps中用什么命令实现
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Demi
1楼 2013-12-09 15:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ashioulou

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-09 18:55:12
月只蓝: 金币+1, 鼓励新手参与讨论。 2013-12-09 18:55:19
deform
剩下的你自己看網站上的commands就知道了
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-09 16:22:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩欢欢

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ashioulou at 2013-12-09 16:22:20
deform
剩下的你自己看網站上的commands就知道了

你好，我用了fix deform做了压缩，周期性边界条件，单轴z向压缩，可是怎么老是出现这个问题，fix    6 all deform  10 z erate -0.0005 units box
ERROR: Final box dimension due to fix deform is < 0.0 (../fix_deform.cpp:475)。我最大压缩量是20%，timestep是0.001，跑了4000000步，是什么问题呢？求指教
赞一下 回复此楼
Demi
3楼2013-12-17 10:03:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ashioulou

铜虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-18 08:54:36
引用回帖:
3楼: Originally posted by 韩欢欢 at 2013-12-17 10:03:49
你好，我用了fix deform做了压缩，周期性边界条件，单轴z向压缩，可是怎么老是出现这个问题，fix    6 all deform  10 z erate -0.0005 units box
ERROR: Final box dimension due to fix deform is < 0.0 (.. ...

就是壓太大了 錯誤寫得很明顯:Final box dimension due to fix deform is < 0.0
我建議你可以把錯誤的log.lammps檔拿出?碜x一讀 自己算算看你給的commands是不是真的如你所想的那樣
fix  6 all deform  10 z erate -0.0005 units box <是每10步執行一次工程應變-0.0005 跟timestep沒有關係跟你的總步數有關係
意思就是說每10步壓縮0.0005 總共4000000 所以壓縮了400000*0.0005早就超過1 完全不合理!!
官網上的commands寫得很清楚 建議你出問題再讀仔細一點
赞一下 回复此楼
4楼2013-12-17 21:05:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩欢欢

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ashioulou at 2013-12-17 21:05:24
就是壓太大了 錯誤寫得很明顯:Final box dimension due to fix deform is < 0.0
我建議你可以把錯誤的log.lammps檔拿出?碜x一讀 自己算算看你給的commands是不是真的如你所想的那樣
fix  6 all deform  10 z  ...

你好，最后的应变不是这么计算的吗：strain最后是无量纲的，所以要*timestep再乘以run的步数啊，
赞一下 回复此楼
Demi
5楼2013-12-17 22:30:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩欢欢

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ashioulou at 2013-12-17 21:05:24
就是壓太大了 錯誤寫得很明顯:Final box dimension due to fix deform is < 0.0
我建議你可以把錯誤的log.lammps檔拿出?碜x一讀 自己算算看你給的commands是不是真的如你所想的那樣
fix  6 all deform  10 z  ...

-0.0005是应变率单位是/ps ，应变不该这么计算？strain rate 0.0005*timestep 0.001 *每10不压缩一次(run 4000000/10)*100%=20%
赞一下 回复此楼
Demi
6楼2013-12-17 22:47:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ashioulou

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
韩欢欢: 金币+10, ★有帮助 2013-12-18 17:20:36
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-12-19 12:34:17
????????h????????erate -0.0005 ??С??c????????M?r?g?s????c
????????????run??? ??????run??ε?in???
???????x?x????output???????????????????
????ε???????????CLAMMPS???????N???

deform?????????timestep?ж??]???P?S
?????timestep=0.0001????1000 ????????????????Α??-0.00005
????????r?? -0.0001 ??????? -0.00015.....
赞一下 回复此楼
7楼2013-12-18 14:19:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩欢欢

金虫 (初入文坛)
???????:
7?: Originally posted by ashioulou at 2013-12-18 14:19:17
????????h????????erate -0.0005 ??С??c????????M?r?g?s????c
????????????run??? ??????run??ε?in???
???????x?x????output???????????????????
????ε???????????CLAMMPS???? ...

??????????????????????????????????run400??????????
???????????????????????????????????????????????????????????????strain rate -0.01 ,run??20000????timestep ??0.001?????1?????0.01???????????????????????https://icme.hpc.msstate.edu/med ... LAMMPS_input_script
赞一下 回复此楼
Demi
8楼2013-12-18 17:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩欢欢

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 韩欢欢 at 2013-12-18 17:24:17
嗯，我先试试您说的这个方法。如果这样我run400步就可以了。
不过我还是有疑问，发了了连接您，这个是在网上看的单轴压缩例子，例子中是strain rate -0.01 ,run了20000步，timestep 是0.001，是每1步压缩0.01，照 ...

先谢谢您耐心的回复哈
赞一下 回复此楼
Demi
9楼2013-12-18 17:24:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leoluode

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 韩欢欢 at 2013-12-18 17:24:59
先谢谢您耐心的回复哈...

不知道楼主现在还在做分子模拟没有？想问您一下，最后您的应变计算出来还是20%吗
赞一下 回复此楼
10楼2016-07-25 11:45:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 韩欢欢 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +5 苦命人。。。 2026-04-18 6/300 2026-04-19 12:04 by 手机用户
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 291求调剂 +10 关忆北. 2026-04-14 10/500 2026-04-18 23:32 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 化学070300 求调剂 +29 哈哈哈^_^ 2026-04-12 29/1450 2026-04-18 15:56 by Equinoxhua
[考研] 297，工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考博] 求博导｜生物质基多孔碳/超级电容方向，已有相关成果，寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 297，工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[基金申请] RY：中国产出的科学垃圾论文，绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +9 lzmk 2026-04-14 10/500 2026-04-15 20:02 by 学员JpLReM
[考研] 通信工程求调剂！！！ +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 各位老师好，求调剂，本科211，一志愿天津大学生物与医药学硕，差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] B区0809 ，数一英一，290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭