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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 酿酒酵母基因敲除遇到了问题，求高手指点！
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jessie06

木虫 (正式写手)

[求助] 酿酒酵母基因敲除遇到了问题，求高手指点！ 已有1人参与

如题，最近在做酿酒酵母的基因敲除，目的基因是一段~150bp的nc RNA，利用同源重组原理从pMY17上PCR获得一段两端同源的DNA片段对酵母进行了醋酸锂转化，鉴定时，质粒上的片段是重组上去了，但同时要敲除的目的基因A依然存在，如图所示，是什么情况？如何解决？新手求指导！！金币不多，略表谢意！
酿酒酵母基因敲除遇到了问题，求高手指点！
未命名.JPG
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1楼 2013-12-03 15:45:12
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)
同源壁太短了，我当时敲除的时候上下游同源臂各有200bp基本一敲一个准。而且你的基因是否在基因组上是单拷贝？由于你的目的基因太短，用引物扩增时候很容易有非特异性扩增，建议敲除引物设计要长一点

[ 发自小木虫客户端 ]
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14楼2015-06-19 22:28:43
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jessie06

木虫 (正式写手)
肿么木有人捏。。急！
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2楼2013-12-04 08:52:59
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zilinweizhu

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jessie06: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-04 10:53:08
你做的是什么交换方式，单交换重组是不能替换基因组上的DNA的，双交换才可以替换，还有就是多倍体要考虑是否完全替换，一般多倍体双交换完全比较困难，需要多次筛选。
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3楼2013-12-04 09:56:42
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三蛰

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jessie06: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-04 10:53:20
还有问题就是可能质粒载体Marker两侧的同源臂与酵母基因组除目的基因外的其他基因有同源性，从而把他取代了？只是假设
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我不会！
4楼2013-12-04 10:16:25
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