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opna

新虫 (初入文坛)

[求助] AIM如何使用(急!!!) 已有1人参与

求助各位高手,在文献中经常看到AIM分析电子密度 我想知道不同键的电子密度是如何分析的 AIM只是一个软件还是通过测样分析??
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2014-02-21 20:53:11
AIM是一个理论,能够做AIM分析的软件很多,楼上提到的都可以,但是大部分是收费的,我尝试着用高斯做过但是一放进去就报错,数据能出来,但是听说不可靠,而且没有办法做出相应的电荷密度差分图,我试着用AIMALL做了,效果不错,但是我用的是试用版,只能算9个分子和300个基函数以内的分子,大分子的计算就没办法了,除非去买,要接近一千美金,后来我听说Multiwfn不错,我用了一下,还不错,不过也在摸索,今天看到一篇文献上就是用这个画出来的图和用AIMALL的效果差不多。(对了AIMALL的官方软件好像去申请,我写了一封信才给我账号密码)
平生多磨砺,男儿自横行!
8楼2014-02-21 20:44:42
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+8 2013-12-02 17:28:14
AIM是主要由Bader发展的一套流行的用于分析电子结构问题的理论,其介绍、综述在这里有合集:http://pan.baidu.com/share/link? ... p;amp;uk=1074012119。另外在Multiwfn 2013年培训的课件包http://pan.baidu.com/s/15OxzP里的day1中的Some concepts in wavefunction analysis的后半部分也有图文并茂的介绍。AIM主要基于对实空间函数(电子密度、电子密度拉普拉斯函数、动能密度等)以绘图、拓扑分析和盆积分方式来研究。

能做AIM分析的程序极多,包括Multiwfn、AIM2000、AIMALL、Morphy、AIMPAC、Xaim、aimuc、promolden、PAMoC、InteGriTy、Bader、DGrid等等,但流行的只有前五个。由于AIM内涵丰富,涉及到的分析方式较多,列举的这些程序后一半只能支持其中少部分分析。

Multiwfn (http://Multiwfn.codeplex.com)免费、开源、灵活、速度快、结果可以直接可视化、手册详尽、功能全面,是最为推荐的AIM分析程序。Multiwfn的拓扑分析功能的用法介绍见《使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/c84fa5089156806dd55a11c3)以及其手册3.14节的原理介绍和4.2节的实例。

Multiwfn的盆分析的用法见《使用Multiwfn做电子密度、ELF、静电势、密度差等函数的盆分析》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/47427a1487ce95633e87ce25)以及其手册3.20节的原理介绍和4.17节的实例。

Multiwfn的绘图功能(绘制曲线图、平面图、等值面图)的例子分别见其手册4.3、4.4、4.5节。

Multiwfn的入门必读见《Multiwfn入门tips》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/896ee3a19f6d7d3c020a4d76)。Multiwfn 3.0版的综述见《Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/b35581418db96cea1f19bc09
2楼2013-12-02 16:38:51
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opna

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-12-02 16:38:51
AIM是主要由Bader发展的一套流行的用于分析电子结构问题的理论,其介绍、综述在这里有合集:http://pan.baidu.com/share/link?shareid=479253&uk=1074012119。另外在Multiwfn 2013年培训的课件包http://pan.bai ...

谢谢啊 但是我合成铁-稳定剂配合物,我想看铁和高分子稳定剂之间的键能 AIM能分析吗 我的稳定剂中有的含多种官能团 AIM分析不需要样品扫描什么的吗 纯软件程序分析??本人环境专业 对这方面不了解 求指教 万分感谢
3楼2013-12-02 19:56:09
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2013-12-02 20:23:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by opna at 2013-12-02 19:56:09
谢谢啊 但是我合成铁-稳定剂配合物,我想看铁和高分子稳定剂之间的键能 AIM能分析吗 我的稳定剂中有的含多种官能团 AIM分析不需要样品扫描什么的吗 纯软件程序分析??本人环境专业 对这方面不了解 求指教 万分感谢...

AIM没法直接给出键能(除非对个别类型体系借助前人拟合的经验公式)。计算键能最直接的方法就是计算结合稳定剂前后体系的能量差,所有从头算量子化学程序,诸如Gaussian,都能做到。
量化计算,包括AIM,都只需要在电脑上算。
4楼2013-12-02 20:02:00
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