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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 问一个关于聚合物体系平衡的问题
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wangzhikun

金虫 (小有名气)

[交流] 问一个关于聚合物体系平衡的问题

聚合物盒子建好之后，想要对体系进行平衡，我直接在高温（600K）下进行500ps的NPT 模拟，体系密度达到稳定，然后直接将温度降到300K进行500ps的NPT模拟，然后数据收集阶段就是在300K下跑NVT了。各位对有关构型的平衡方法有何看法？
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1楼 2013-12-01 09:16:06
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)
引用回帖:
25楼: Originally posted by wangzhikun at 2014-12-11 16:43:29
直接用的anneal来做退火，最高温度的选择是参考的文献值。我个人觉的这个温度可以大一点，七八百也行。...

非常感谢，还有一些问题就一块问了。。。。
1、我模拟的体系包含一个聚合物1700个单体，6000个甲醇分子，1000个醋酸乙烯分子，共约9000分子（聚合物按照单体算），80000个原子，这样的体系MS能计算么，我这边是用刀片算的；
2、我是要构造一个包含聚合物和分子的盒子，那么我的退火过程是应该在构建盒子之前还是先构建盒子再退火呢？
3、还有就是我看大家模拟过程中做MD都是先NVT后NPT或者先NPT后NVT，这两个哪个更准确一些呢，原理是什么呢？

望不吝赐教啊~~非常感谢~~
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26楼2014-12-11 17:55:40
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maomaosmmu

金虫 (小有名气)
★
wangzhikun(金币+1): 谢谢参与

等等我去看一下
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9楼2013-12-01 10:52:30
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kiss200855373楼
2013-12-01 10:12   回复  
wangzhikun(金币+1): 谢谢参与
！ [ 发自小木虫客户端 ]
hppdyx6楼
2013-12-01 10:24   回复  
wangzhikun(金币+1): 谢谢参与
祝福 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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