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kent1022

金虫 (著名写手)

[求助] Aguado-Paniagua函数拟合 已有1人参与

尝试用A-P函数拟合A-BC体系的势能面,有几个问题自己无解。
1.单体项、两体项和三体项应该是一起拟合吧?对于基态势能面,单体项均为零,所以只需要拟合两体、三体项?
2.势能面扫描时是两个键长,一个键角,得到的结果是不是要转换为Rab、Rbc、Rac?个人觉得应该是,那在拟合时不是就有3个自变量了?
3.对一双原子分子进行了单点能扫描,用M-S 函数可以很方便的拟合。而用A-P函数拟合总是“Fit did not converge - reason unknown”,是AP函数只适用于多原子分子还是我的初始值不合适?
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清新俊逸

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-28 22:26:41
kent1022: 金币+20 2013-11-29 20:39:02
给你推荐两篇文章,用神经网络拟合吧,Matlab有现成的toolbox。
Chen, J., X. Xu, et al. (2013). "A global potential energy surface for the H2 + OH ↔ H2O + H reaction using neural networks." The Journal of Chemical Physics 138(15): 154301.
Jiang, B. and H. Guo (2013). "Permutation invariant polynomial neural network approach to fitting potential energy surfaces." The Journal of Chemical Physics 139(5): 054112.

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2013-11-28 18:17:45
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-11-28 16:04:36
kent1022: 金币+20 2013-11-29 20:38:00
这个函数形式是什么呢?
三原子分子势能面一定是三个自变量。
如果说没有converge,说明函数形式有非线性自变量,否则没有收敛问题。一般非线性自变量一定要给出接近正确的初值才能收敛到正确结果。

除非你试图拟合多个耦合势能面,或者非线性项的特性非常清楚,否则使用带非线性自变量的函数形式很不方便,也很难扩展未知数的个数。

如果是基态势能面,建议看看joel bowman的拟合方法,短平快,精度也可以。
2楼2013-11-28 15:51:47
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kent1022

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by virtualzx at 2013-11-28 15:51:47
这个函数形式是什么呢?
三原子分子势能面一定是三个自变量。
如果说没有converge,说明函数形式有非线性自变量,否则没有收敛问题。一般非线性自变量一定要给出接近正确的初值才能收敛到正确结果。

除非你试图 ...

A-P函数
Aguado-Paniagua函数拟合
1.png


Aguado-Paniagua函数拟合-1
2.png


Aguado-Paniagua函数拟合-2
3.png


Aguado-Paniagua函数拟合-3
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Aguado-Paniagua函数拟合-4
5.png

3楼2013-11-28 16:19:37
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kent1022

金虫 (著名写手)

我要拟合基态势能面。三个自变量为Rab,Rbc,Rac,并且Rab+Rac <= Rbc
如你所言,二体项和三体项中的alpha和beta都是非线性参数,其它的ci和dijk为线性参数。但非线性自变量的初值不知大概为多少。

另外,我用origin编写这个函数,二体项应该没有问题,但origin好像只支持一维和二维数组,不支持三维数组,这就麻烦了。还是我应该换根据进行拟合?
4楼2013-11-28 16:25:21
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