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sckcf

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问设计引物前为什么要进行同源性比较??

如题设计引物前为什么要进行同源性比较??怎样进行同源性比较。。是和谁比较同源性比较啊??比较了同源性又怎样根据它设计引物???跪求分子高手帮忙???
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铜虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by wangweida2 at 2013-11-25 12:01:01
补充一下,同源性比较的话是和所用模板比较。比如你是以小鼠基因组为模板,设计的引物就是和小鼠基因组比较。目的是看引物有没有非特异性结合位点,特别要避免非特异性结合位点的3'末端完全配对。

麻烦在问一下。。。如果我要设计某细菌的一个外膜蛋白的引物(序列未知)。。。是不是要相近细菌的那个外膜蛋白,找同源性高,且而保守序列来设计引物。。还是说相近细菌的随便哪个基因设计引物???
11楼2013-11-25 15:33:58
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-25 20:35:17
谁说了设计引物前要进行同源性比较,如果知道序列,直接涉及就是了,看你的目的是什么
2楼2013-11-24 20:42:31
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铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zh10246 at 2013-11-24 20:42:31
谁说了设计引物前要进行同源性比较,如果知道序列,直接涉及就是了,看你的目的是什么

我想搞个基因原核克隆表达。。。。同源性比较有什么意义啊,是不是同一属不同种之间比较啊??
3楼2013-11-24 20:55:14
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-11-24 21:46:32
看基因的相似性有多少,功能区是否保守,不一定,可以是人,小鼠,大鼠,狗,猫的同源基因比较
4楼2013-11-24 21:10:34
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