24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2778  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xdfy0301

新虫 (初入文坛)

[求助] 定点突变蛋白质不表达已有1人参与

近期,做了几个点的定点突变,突变点是通过软件模拟得到的。通过突变,转化发酵,结果突变体没有酶活。突变体DNA测序表明突变正确,没有移码。但未能找到不表达的原因,向各位求助,指点一下何种原因导致不表达,谢谢。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woolley

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
xdfy0301: 金币+4 2014-04-27 23:26:30
分析原因其实是个很麻烦的事情
像你的这种情况,比较可能的是
1.你的蛋白表达量低了,被内源条带遮盖,你可以尝试纯化一下看看,或者按楼上的建议跑一下western
2.你的蛋白突变后导致折叠问题,比如折叠出错或者变慢,导致疏水区暴露,或者在折叠某一时段暴露,然后被内源的蛋白酶系统降解
3.你突变后改变了mRNA的二级结构或稳定性,导致核糖体结合mRNA困难,或者mRNA快速降解。针对这种情况,你可以用同义密码子替换一下突变位点(或附近)的碱基,看看有没有效果
小概率的原因
4. 你突变后的位点是内源蛋白酶的识别位点
5. 如果你使用的是试剂盒进行突变(过程中复制了整个质粒),那么运气不好的话,在转录区域,RBS区域等发生突变,导致转录困难。

建议你用同义密码子突变替换一下现有的突变,如果还是不表达的,换一下突变位点的氨基酸类型
如果更换密码子有效果,问题可能在mRNA方面
如果更换氨基酸残基类型有效果,那么问题可能在折叠或构象方面
12楼2014-04-14 11:14:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-23 01:23:52
xdfy0301: 金币+2 2013-11-24 20:09:55
定点突变蛋白质不表达和结果突变体没有酶活不是一回事吧,你的蛋白是否表达呢,做个western看看
2楼2013-11-22 20:40:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xdfy0301

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zh10246 at 2013-11-22 20:40:22
定点突变蛋白质不表达和结果突变体没有酶活不是一回事吧,你的蛋白是否表达呢,做个western看看

跑过SDS变性电泳,没有目的条带(正常目的条带很粗)因此,推测为没有表达
3楼2013-11-23 16:31:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南子枫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xdfy0301: 金币+1 2013-11-24 20:10:03
难道是你突变的位点对表达有重要作用?
RT-PCR看看有没有转录活性如何?
4楼2013-11-23 19:31:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见