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0050910002

木虫 (正式写手)

[求助] 用Fast DNA spin kit for soil试剂盒提取微生物总DNA

样品为腌制雪里蕻,为了获得大量菌体,我将腌制雪里蕻用pbs洗涤2次,然后离心洗涤液收集菌体,收集到的菌体直接用于DNA提取,其余完全按照试剂盒说明进行操作,从样品中提取微生物总DNA浓度检测结果如下:
样品编号        260        280        320        260/280        ug/mL
1        0.1849        0.0983        0.02        1.8806        92.469
2        0.5508        0.2941        0.0666        1.873        275.3879
跑出电泳结果如图片所示,本人怀疑是fastprep破碎时间和速度太大,将DNA打碎所致,将fastprep速度和时间降低为:4.5m/s,40s,结果依然有弥散现象。有没有哪位研究人员知道为什么DNA条带不单一,为什么会出现弥散现象呢?
用Fast DNA spin kit for soil试剂盒提取微生物总DNA
2013-11-18.jpg
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Neversaygoodbye
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xl2420

银虫 (小有名气)

A260/A280在1.8~2.0之间,说明DNA的纯度可以。出现弥散的猜测:反应体系的成分;PCR反应程序
xiaoling
4楼2013-11-23 13:35:33
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肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
0050910002: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-23 09:49:34
我也用过这个试剂盒,提取土壤DNA。有时候我一批提取多个样品的基因组,有的就有特异条带,有的样品也会像你这样有弥散现象,所以我觉得也许不是提取的问题,而是样品本身的问题。
最主要的是,不知lz提取酸菜的菌体基因组用来干嘛,如果只是用作pcr模板的话,就你提取的基因组质量足够了,不影响pcr。
顺便说一下,想起小时候吃雪里红的泡菜,哎呀,我饿了
2楼2013-11-22 21:58:30
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0050910002

木虫 (正式写手)

,做宏基因测序。测序公司说不是很理想呀
Neversaygoodbye
3楼2013-11-23 09:48:57
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0050910002

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xl2420 at 2013-11-23 13:35:33
A260/A280在1.8~2.0之间,说明DNA的纯度可以。出现弥散的猜测:反应体系的成分;PCR反应程序

这个是提取DNA的检测图片,不是PCR检测图片
Neversaygoodbye
5楼2013-11-23 15:34:52
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