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向日葵2012

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何把.gjf文件转换为.mol文件

做MD计算,处理数据时用Chem3D打开时有太多的水分子看不清楚离子间成键情况,考虑把.gjf文件转换为.mol文件在Hyperchem中打开以便删去多余不成键的水分子,观察生成的离子簇情况
本人新手,望路过的大侠指导一二,定不胜感激。。。。。
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勿忘心安
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-22 14:30:18
引用回帖:
5楼: Originally posted by 向日葵2012 at 2013-11-21 18:47:00
那推荐一下唄,我试试看...

使用我之前说的GaussianView就可以实现格式转存功能。
努力的生活着
6楼2013-11-21 18:52:23
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查看全部 14 个回答

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-11-21 15:22:39
向日葵2012: 金币+8, ★有帮助, 辛苦啦,谢谢你的回答! 2013-11-26 08:48:45
gjf格式?这个格式不是高斯计算的输入文件格式吗?如果想把这个转存成mol或者mol2格式,直接用GaussianView打开这个gjf文件,然后另存成mol格式的文件就可以了。
努力的生活着
2楼2013-11-21 14:38:39
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向日葵2012

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wangyan10 at 2013-11-21 14:38:39
gjf格式?这个格式不是高斯计算的输入文件格式吗?如果想把这个转存成mol或者mol2格式,直接用GaussianView打开这个gjf文件,然后另存成mol格式的文件就可以了。

我试了,可是直接保存为.mol文件后在Chem3D
中打不开呀
勿忘心安
3楼2013-11-21 17:11:18
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-22 14:30:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by 向日葵2012 at 2013-11-21 17:11:18
我试了,可是直接保存为.mol文件后在Chem3D
中打不开呀...

看图软件有那么多。。。为何纠结与Chem3D。。。
努力的生活着
4楼2013-11-21 18:22:47
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