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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » polymer 初始结构
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linyusuc

银虫 (小有名气)

[交流] polymer 初始结构

大家在进行复杂的聚合物体系的全原子模拟的时候，都是如何建构初始体系的呢，如何获得较好的能量最小化的结构呢，有什么高明的方法吗？请大家积极畅所欲言吧！
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1楼 2013-11-20 20:50:39
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linyusuc

银虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-11-24 07:54:57
你没学过分子模拟的课程？判断平衡，看内能、温度是否基本恒定，计算一下一些物理量的弛豫时间，一般前2倍弛豫时间为跑平衡的阶段。...

谢谢你的积极帮助，我再去学习一下相关内容，因为之前没做过这方面的，所以好多都不是很理解！ 万分感激你的帮助！
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13楼2013-11-24 18:08:08
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
★ ★
linyusuc(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 09:08:19
最好高温下松弛一下晶胞结构
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2楼2013-11-20 21:38:51
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
★ ★
linyusuc(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 09:08:27
无规行走生成高分子主链。能量最小化这一步骤不是必须要有的
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3楼2013-11-20 22:34:22
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linyusuc

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-11-20 22:34:22
无规行走生成高分子主链。能量最小化这一步骤不是必须要有的

你好，谢谢你的积极讨论，因为对高分子相关的方面的欠缺，并不是很明白你的意思，为什么不是必须要有的呢？ 我在进行相关的模拟研究的时候就发现，能量最小化的时候体系的范德华相互作用能是非常大的，这样的结构在进行MD的时候很容易就导致失败，那么请问你有什么高见来解决这种范德华相互作用过大的情况吗？
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4楼2013-11-21 07:09:27
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