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雪花纷芬

金虫 (小有名气)

[求助] CIF文件错误处理

晶体解完，检查CIF文件出现如下问题，怎么解决？谢谢大家
Alert level B
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C10     ..        9.6 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C11     ..        8.5 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C9     --  C8_d    ..        9.0 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C12    --  C8_d    ..       10.1 su   
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C9     -   C10_g  ...       1.73 Ang.  
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C11    -   C12_g  ...       1.75 Ang.  
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        173 Ang3
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1楼 2013-11-19 20:28:58
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雪花纷芬

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 546672286 at 2013-11-20 08:42:47
Hirshfeld Test Diff for         N2     --  C10     ..        9.6 su   

解决方法：ins 文件里加入 delu 0.02 N2 c10

我想问一下，这个0.02是怎么确定的？
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6楼2013-11-20 10:29:04
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forever1706

禁虫 (知名作家)
同问高手，我以前也经常遇到这类问题，貌似是键长的精度不够，以前都没处理，直接用了。
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2楼2013-11-20 02:25:13
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forever1706

禁虫 (知名作家)
2楼说的是前4个B类，后面的

PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C9     -   C10_g  ...       1.73 Ang.  
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C11    -   C12_g  ...       1.75 Ang.

这个可不是键长精度问题啊，你的CC键怎么会这么长，会不会原子指认错了。
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雪花纷芬
3楼2013-11-20 02:26:58
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
雪花纷芬: 金币+10, ★有帮助 2013-11-20 10:27:54
最后一个问题是由于还有未定完的原子，可能还有溶剂
赞一下(1人) 回复此楼

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雪花纷芬
4楼2013-11-20 08:40:58
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