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雪花纷芬

金虫 (小有名气)

[求助] CIF文件错误处理

晶体解完,检查CIF文件出现如下问题,怎么解决?谢谢大家
Alert level B
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C10     ..        9.6 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C11     ..        8.5 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C9     --  C8_d    ..        9.0 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C12    --  C8_d    ..       10.1 su   
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C9     -   C10_g  ...       1.73 Ang.  
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C11    -   C12_g  ...       1.75 Ang.  
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        173 Ang3
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forever1706

禁虫 (知名作家)

2楼说的是前4个B类,后面的

PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C9     -   C10_g  ...       1.73 Ang.  
PLAT367_ALERT_2_B Long?  C(sp?)-C(sp?) Bond  C11    -   C12_g  ...       1.75 Ang.

这个可不是键长精度问题啊,你的CC键怎么会这么长,会不会原子指认错了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2013-11-20 02:26:58
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forever1706

禁虫 (知名作家)

同问高手,我以前也经常遇到这类问题,貌似是键长的精度不够,以前都没处理,直接用了。
2楼2013-11-20 02:25:13
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
雪花纷芬: 金币+10, 有帮助 2013-11-20 10:27:54
最后一个问题是由于还有未定完的原子,可能还有溶剂

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-11-20 08:40:58
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Hirshfeld Test Diff for         N2     --  C10     ..        9.6 su   

解决方法:ins 文件里加入 delu 0.02 N2 c10
5楼2013-11-20 08:42:47
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