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细菌、真菌进化树问题
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lhf903
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细菌、真菌进化树问题
提取土壤样品总DNA,PCR-DGGE分析群落结构,对DGGE片子上的条带切胶回收后测序,现得到细菌、真菌几十条序列,进化树已建好,不知道标注条带归属的时候真菌和细菌分别有什么注意的嘛,是统一按照门,纲,目,科,属中某一级别来分,还是可以有门,有纲之类其他的;另外是不是分的越细越好~
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【求助/交流】鉴定出细菌的16SrDNA,请问如何构建系统发育树?
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1楼
2013-11-18 16:26:49
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yht5657
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lhf903: 金币+10,
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2013-11-19 21:00:56
一般都是DGGE 做细菌的,再说你做PCR时引物扩真菌一般用18S,细菌室16s,你怎么会有细菌和真菌同时出现,建议你再说具体点
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2楼
2013-11-19 08:59:22
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lhf903
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专业: 环境微生物学
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2楼
:
Originally posted by
yht5657
at 2013-11-19 08:59:22
一般都是DGGE 做细菌的,再说你做PCR时引物扩真菌一般用18S,细菌室16s,你怎么会有细菌和真菌同时出现,建议你再说具体点
是的,我是分别建树~细菌一棵,真菌一棵
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3楼
2013-11-19 09:22:41
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