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不离不弃1215

铜虫 (小有名气)

[求助] 荧光定量PCR扩增曲线怎么成这样了呢?为什么? 已有5人参与

各位大神,帮帮忙呀!小妹我是荧光定量PCR的初学者,实验室有没有一个人做过荧光定量PCR 实验,现在老师把这个新东西给我了,要我建立这个体系,一切靠自己,慢慢的摸出点门道了,可是现在却出现这个问题,真的是纠结了两个月了还是没办法,现在你们是我最后的希望了。别的不多说了,大家看图吧,我用的仪器是ABIA的STEP ONE ,探针法做,结果发现曲线没有对数期,直接的一条线性曲线就出来了,而且看不到平台期,这是为什么呀?天呐,我都快被这个折磨疯了
荧光定量PCR扩增曲线怎么成这样了呢?为什么?
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2009wqg

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果你是做的单通道检测项目,那这个问题一般很好解决:
1、建议做完40个循环。
2、如果40个循环后曲线还是不呈“S”型,建议按荧光PCR通用体系自配试下(网上随便搜个荧光PCR通用体系,dNTP/buffer/Mg离子/酶都可以先采用TAKARA的试下,体系优化没有想象的那么重要)
3、如果以上2者还不行,往往只不过是表明你采用的引物探针效果不好,需要重新设计序列。(探针比较贵,轻易不换,建议你先多设计几对引物序列,然后再按通用体系扩下,对了模板就用质粒就行了——不清楚质粒用多大浓度,则把小量提取的质粒从原液做10倍、100倍、1000倍、10000倍、100000倍稀释就行了)实在换引物不行,再考虑重新设计探针和引物(甚至换扩增区间)。
13楼2014-04-29 15:29:53
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yangpanfei

禁虫 (正式写手)

★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-11-18 11:02:07
本帖内容被屏蔽

2楼2013-11-18 08:50:51
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-11-18 11:02:11
你这个是多重的还是单重,看起来好像是双重的,你把体系浓度发出来,看看
3楼2013-11-18 08:58:17
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lzliang87

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-22 13:00:46
你是用探针法做的QPCR,出现这种情况很正常的,几年前我刚刚开始做QPCR的时候这种情况也出现过,最后完美解决,呵呵。几年来一直做QPCR积累了不少经验,想详细了解的话q聊吧,比较方便,913668017
4楼2013-11-18 17:38:04
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