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浪人南

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于pET32a载体构建后,双酶切鉴定不正确~求助

情况是这样,我有一个1100的目标片段,准备连入pET32a质粒(5900),设计引物时已连上了酶切位点。
而后我PCR得到目的片段,回收,连T载体,测序,正确(包括酶切位点)
而后我双酶切T载体,及pET32啊,回收T载体上1100的片段已经5900的pET32a
T4连接过夜,转化凃板,挑单菌落。这时我用特异引物进行菌液PCR,能P出目的条带;
为了进一步坚定,我提了质粒进行双酶切,这时问题来了,切出的条带居然是1100和3000左右的条带
这是怎么回事呢,我用pET32a的序列查了下确实没同样的酶切位点会把载体切断,那怎个3000是怎么出来的呢?
而且连涂了好几个板,出的都是这一摸一样的结果,蛋疼啊,求帮助~~~谢谢
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-19 15:07:36
可以直接连接pET32a,省去T载体看看,这样还快,少一轮克隆。
4楼2013-11-17 23:06:46
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-11-17 12:35:26
回收pET32a载体片段后是否电泳检查了大小?此外PCR验证克隆时可能出现假阳性。提出阳性克隆的质粒单酶切看看大小是否是7K还是4K多。
2楼2013-11-17 02:45:06
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-11-17 12:35:31
直接把质粒送去测序鉴定就知道有没有构建成功了,1000bp的话,测通很容易
如果没有成功,就不用考虑3000bp的事情
如果测序是对的,那你可以把双酶切的位点换一下,pet32上面酶切位点也还不少
3楼2013-11-17 10:46:13
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huahu3600

新虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-19 15:07:42
首先,你的目的片段,并没有成功连接到pET32a.现在还是在T载体上,3000的条带是T载体。
其次,菌液PCR说明不了问题。如果要说明问题,上下游引物要一个在载体上,一个在目的片段上。
再次,T载体跟pET32a上面都有很多多克隆位点,设计的时候要分析透彻,看清楚。

PS双酶切一定要酶切彻底,这很关键。不同的酶buffer不一样。如果没有共用buffer,可以分部酶切。

希望能帮到你。
5楼2013-11-18 15:07:03
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