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CF3COOH（介电常数为：8.55）作溶剂，计算分子溶剂化能的详细输入文件！！！
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请教各位大神，高斯中没有的溶剂化模型如何建立？以CF3COOH(介电常数 8.55）为溶剂，计算一个分子的溶剂化能，急求该计算的详细输入文件！ 情况紧急，还望各位不吝赐教！不胜感激！！！ |
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 计算 | gaussian |
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8楼2013-11-15 06:39:09
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【答案】应助回帖
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http://muchong.com/html/201302/5536617.html 这里有讲。 以下节选自高斯09说明书： PCM计算的附加关键词 PCM SCRF计算可以指定附加的输入关键词。它们位于独立的输入部分，像往常一样用空行结束，如这个例子： # B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) Water, solvation by methanol, re-defined as generic solvent. 0 1 O H,1,0.94 H,1,0.94,2,104.5 stoichiometry=C1H4O1 PCM关键词的输入部分 solventname=methanol eps=32.63 epsinf=1.758 … PCM输入的结束空行 可以用以下关键词控制 PCM 计算（有关的项目分组排列）： 定义溶剂参数 PCM 计算所用的溶剂通常可以用SCRF 关键词的常规选项Solvent 指定。可以用下面 的关键词覆盖一些已知溶剂的默认值： EPS=x 指定溶剂的静态（或零频）介电常数。 EPSINF=x 指定溶剂的动态（或光学）介电常数。 RSOLV=x 指定溶剂半径（单位：埃）。只用于AddSph 或Surface=SAS。 未指定的参数默认为Solvent选项所指定溶剂（默认是水）的值。 这两种说法矛盾的地方就是一个是直接用read，一个是用pcm=read，孰对孰错自己尝试吧。 |
2楼2013-11-11 06:44:46
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再请教几个问题： 1. 关键词命令行：# B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) 中的"5D" 是什么意思啊? 2.如果含有: stoichiometry=C1H4O1 solventname=methanol 计算报错,去掉则可以正常运算,不知是何原因? 3.即使按照该输入文件计算,能够在out 文件中看到我建立的新的溶剂模型，但没有计算结果，也就是没有我要的溶剂的相关一些列能量值（气相，极性溶剂极性溶质能量，总溶液能量，溶剂自由能，溶剂化能..) 见附件：H2O-ch3oh.gjf 和 H2O-ch3oh.out 4.针对上一个问题，我在命令行加入了关键词：ExternalIteration,DoVacuum" 貌似可以得到全部的结果，不知是否可靠？ 见附件：H2O-ch3oh-3.gjf 和 H2O-ch3oh-3.out |
3楼2013-11-11 16:45:29
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