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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 控诉一下Gaussian09A01的L914
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 控诉一下Gaussian09A01的L914 已有4人参与

[root@Mizar ~]# uptime
10:11:20 up 117 days, 22:45,  1 user, load average: 2838.19, 2837.98, 2837.59

[code] %chk=rotate-80.chk   
%nproc=7              
Will use up to    7 processors via shared memory.
%mem=15gb            
Default route:  Punch=Archive MAXDISK=200GB OPT=NoEigenTest SCF=Tight MP2=SemiDi
rect geom=(nodistance, nodihedral, noangle) sym=loose cachesize=131072
----------------------------------------------------------------------
#p cam-b3lyp lanl2dz td(nstates=30,conver=3) geom=connectivity symm=lo
ose                  
----------------------------------------------------------------------
Stoichiometry    C72H48N32O24Y(2)   
Framework group  D2[O(Y),X(C72H48N32O24)]
Deg. of freedom   132      
Full point group                 D2      NOp   4
Largest Abelian subgroup         D2      NOp   4
Largest concise Abelian subgroup D2      NOp   4
  1270 basis functions,  3441 primitive gaussians,  1272 cartesian basis functions
   454 alpha electrons      453 beta electrons
这Gaussian09 A01的L914的调度简直就是渣啊，就算这么个小任务，就把平均负载搞到2000多，系统基本无法工作了啊，奶奶个熊
看来早日换成Gaussian09D是好的

[ Last edited by yjcmwgk on 2013-11-6 at 13:45 ]
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1楼 2013-11-06 09:39:29
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nono2009
2楼2013-11-06 09:48:25
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abdoman

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
nproc=7  ??
你怎么想到用7个啊！
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Youcompleteme.
3楼2013-11-06 09:54:09
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by abdoman at 2013-11-06 09:54:09
nproc=7  ??
你怎么想到用7个啊！

上个任务用了nproc=8，发现死卡
这次任务减掉一个，发现还是死卡
这时候才想起来查看平均负载，结果吓了一跳
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4楼2013-11-06 10:00:47
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fubest

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
上个任务用了nproc=8？我四核的电脑才用到4
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5楼2013-11-06 10:10:28
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abdoman

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好歹用个偶数嘛。
4个倒是不错！
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Youcompleteme.
6楼2013-11-06 10:17:10
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abdoman

木虫 (著名写手)
另外，你是linux，写NFS的硬盘吗？
你的temp文件写什么地方，有时候读写也是卡的原因之一
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Youcompleteme.
7楼2013-11-06 10:18:14
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
7楼: Originally posted by abdoman at 2013-11-06 10:18:14
另外，你是linux，写NFS的硬盘吗？
你的temp文件写什么地方，有时候读写也是卡的原因之一

额 我跟nfs毫无关系 就是非常普通的Centos6操作系统ext4文件系统
tmp的位置呢，这么说吧，我的账户是q，而我的tmp就是/home/q/tmp，tmp的创建者就是q，权限700，高斯的可执行文件的文件夹的创建者也是q，权限也是700。按说毫无问题的说
其实我觉得自己挺独的。凡是权限设置700的都是独来独往的人

[ Last edited by yjcmwgk on 2013-11-6 at 10:43 ]
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8楼2013-11-06 10:42:14
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abdoman

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by yjcmwgk at 2013-11-06 10:42:14
额 我跟nfs毫无关系 就是非常普通的Centos6操作系统ext4文件系统
tmp的位置呢，这么说吧，我的账户是q，而我的tmp就是/home/q/tmp，tmp的创建者就是q，权限700，高斯的可执行文件的文件夹的创建者也是q，权限 ...

你的HOME 默认就是700.
高斯也不允许777，所以一般也是750，考虑到你自己安装的Gaussian
估计也是在自己文件夹下面，所以750和700 没差别。

所以你的独，是系统默认的独。你适应这样，而且也不愿意改变。
你自认自己挺独的，其实也许是因为环境：孤身一人。能不独吗？
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Youcompleteme.
9楼2013-11-06 12:28:03
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
9楼: Originally posted by abdoman at 2013-11-06 12:28:03
所以你的独，是系统默认的独。你适应这样，而且也不愿意改变。
你自认自己挺独的，其实也许是因为环境：孤身一人。能不独吗？

我咋脚着这么哲学涅……
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10楼2013-11-06 13:43:28
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