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1994dancer

新虫 (初入文坛)

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[求助] 18s rDNA和ITS序列鉴定藻种的引物问题

最近想鉴定一株藻，之前通过形态观察，大致上认定为栅藻，想通过18s rDNA和ITS序列鉴定，进一步确定到“种”。看了一些文献，他们用的引物差别都很大，文章中说的什么通用引物或者是自己合成的引物找不到一点相似性，现在都不知道用什么引物好了！求做过这方面的人指点一下。。。

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1楼2013-11-03 12:30:04

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若离1221

银虫 (小有名气)

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引用回帖:

6楼: Originally posted by 1994dancer at 2013-11-04 20:11:13
谢谢啦！找到这篇文章了！那个貌似是做冬虫夏草，不知道对藻类能不能扩增得出来，先试试看！...

我看的不是冬虫夏草的文章啊，我看的是一篇海水赤潮鉴定各种藻类的，后来我用这个引物对一个来自长江水的样品进行pcr，blast后确实有很多藻类。
我找找序列。
18N5： 5’-TGGTGCCAGCAGCCGCGGTA-3’
18N11R： 5’-CTCAGTAAGCTTGATCCTTCCGCAGGTTCACC-3’
PCR反应条件： 94℃ 3min；30×（94℃ 30s；55℃ 30s；72℃ 1min），72℃ 5min，12℃ hold。