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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 分子优化
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大家一起来

新虫 (小有名气)

[求助] 分子优化

我用G09优化一个带有羧酸基团的分子结构，优化的时候我把羧酸变为了羧酸根，也就是带一个负电荷。但结果是优化完后羧酸中的两个氧和碳原子都是成双键，而不是那种类似共轭的双键（一个实的键一个虚的键）由于我的分子中含两个苯环和羧酸根相连，那么应该是共轭的，为什么我的羧酸根是这样子呢，想请教高手这种结果正常吗？下面是我优化好的结果，大侠指教呀
分子优化
图片1.jpg
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1楼 2013-10-30 15:53:19
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scx235

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
大家一起来: 金币+1, ★有帮助, 哦哦，在最终优化好的结构上也可以改变键的类型？那对下面的计算有没有影响呢？ 2013-10-31 09:21:49
如果C原子的价键不对，也可以在优化好的结构上改变键的类型，但不能改变键长。
分子优化-1
123.png
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量子化学计算
6楼2013-10-31 08:59:48
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+1 2013-10-30 20:34:48
大家一起来: 金币+1, ★有帮助, 谢啦 2013-10-31 09:19:04
不用太过在意GV里键的样子，关键还是看你的输出文件里给出的数据和得到的分子坐标
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2楼2013-10-30 17:02:18
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大家一起来

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-30 17:02:18
不用太过在意GV里键的样子，关键还是看你的输出文件里给出的数据和得到的分子坐标

那关键是看哪些数据呢，我刚接触计算不太懂，分子坐标是指什么呢，谢啦
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3楼2013-10-30 20:20:09
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
大家一起来: 金币+1, ★有帮助, 想请教大侠是怎么判断正常的呢？GV的图像就不用管了？ 2013-10-31 09:20:13
正常的，不用担心，没有问题。
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4楼2013-10-30 21:49:00
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