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大家一起来

新虫 (小有名气)

[求助] 分子优化

我用G09优化一个带有羧酸基团的分子结构,优化的时候我把羧酸变为了羧酸根,也就是带一个负电荷。但结果是优化完后羧酸中的两个氧和碳原子都是成双键,而不是那种类似共轭的双键(一个实的键一个虚的键)由于我的分子中含两个苯环和羧酸根相连,那么应该是共轭的,为什么我的羧酸根是这样子呢,想请教高手这种结果正常吗?下面是我优化好的结果,大侠指教呀
分子优化
图片1.jpg
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+1 2013-10-30 20:34:48
大家一起来: 金币+1, 有帮助, 谢啦 2013-10-31 09:19:04
不用太过在意GV里键的样子,关键还是看你的输出文件里给出的数据和得到的分子坐标
2楼2013-10-30 17:02:18
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大家一起来

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-30 17:02:18
不用太过在意GV里键的样子,关键还是看你的输出文件里给出的数据和得到的分子坐标

那关键是看哪些数据呢,我刚接触计算不太懂,分子坐标是指什么呢,谢啦
3楼2013-10-30 20:20:09
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
大家一起来: 金币+1, 有帮助, 想请教大侠是怎么判断正常的呢?GV的图像就不用管了? 2013-10-31 09:20:13
正常的,不用担心,没有问题。
4楼2013-10-30 21:49:00
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fubest

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
大家一起来: 金币+1, 有帮助 2013-10-31 09:20:25
GV的图像表示就不要管他
5楼2013-10-30 22:09:50
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scx235

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
大家一起来: 金币+1, 有帮助, 哦哦,在最终优化好的结构上也可以改变键的类型?那对下面的计算有没有影响呢? 2013-10-31 09:21:49
如果C原子的价键不对,也可以在优化好的结构上改变键的类型,但不能改变键长。
分子优化-1
123.png

量子化学计算
6楼2013-10-31 08:59:48
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