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732749120

金虫 (初入文坛)

[求助] NTO出错

在计算完激发态的fchk文件的基础上怎么算NTO？我的输入文件如下：
%Chk=state148.chk
%mem=2500MW
%nprocl=2
# td(read)=(nstates=800,root=600) b3lyp/lanl2dz Guess=Read Pop=(SaveNTO,NTO) density=Transition=148
可是老出错，请问是什么原因，怎么改？
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1楼 2013-10-26 09:19:28
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最好能贴出出错的地方。
你要读取的是fchk，但是你用%chk，是可以这样用的？我是没这样用过
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2楼2013-10-26 12:19:38
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-26 12:19:38
最好能贴出出错的地方。
你要读取的是fchk，但是你用%chk，是可以这样用的？我是没这样用过

我看的是G09help，
SaveNaturalTransitionOrbitals
Save the generated orbitals in the checkpoint file, replacing the canonical ones if the density was read-in from there. SaveNTO is a synonym for this option. If you want to visualize the orbitals, you need to write them back to the checkpoint file. It is a good idea to do so with a copy of the checkpoint file for each state. After the initial excited state calculation (using %Chk ex.chk), use a technique like the following to generate visualization data for each state:

$ cp ex.chk staten.chk                     Copy original checkpoint file.
$ g09 <<END                                Run a Guess=Only job just to generate orbitals.
%Chk=staten                                Use the checkpoint file copy.
# Geom=AllCheck ChkBas Guess=(Read,Only)
  Density=Transition=n Pop=SaveNTO         Repeat process for each state of interest.
END                                        End of Gaussian 09 input file.


NATURAL ORBITAL-RELATED OPTIONS
我按那步骤做的，可是老出错，
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3楼2013-10-27 17:06:59
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-26 12:19:38
最好能贴出出错的地方。
你要读取的是fchk，但是你用%chk，是可以这样用的？我是没这样用过

我用g09打开fchk文件做成这样的输出文件：
%Chk=state148.chk
%mem=2500MW
%nprocl=2
# td(read)=(nstates=800,root=600) b3lyp/lanl2dz Guess=Read Pop=(SaveNTO,NTO) density=Transition=148
结果老出错，错误如下：
End of file in ZSymb.
Error termination via Lnk1e in /scratch/g09/l101.exe at Sun Oct 27 16:36:19 2013.
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4楼2013-10-27 17:24:12
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 732749120 at 2013-10-27 17:24:12
我用g09打开fchk文件做成这样的输出文件：
%Chk=state148.chk
%mem=2500MW
%nprocl=2
# td(read)=(nstates=800,root=600) b3lyp/lanl2dz Guess=Read Pop=(SaveNTO,NTO) density=Transition=148
结果老出错， ...

L101错误说明出错在读取分子说明或标题上，看了一下你的输入，似乎没有对分子说明做定义？

尝试加geom=allcheck试试
另外输入完左右东西最后要空一行。
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5楼2013-10-28 07:15:15
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-28 07:15:15
L101错误说明出错在读取分子说明或标题上，看了一下你的输入，似乎没有对分子说明做定义？

尝试加geom=allcheck试试
另外输入完左右东西最后要空一行。...

我又改了改输入文件如下：
%chk=staten.chk
%mem=2500MW
# Geom=allcheck Chkbas Guess=(read,only) density=transition=148 Pop=(NTO,saveNTO)
结果又错了，错误如下：
Transition densities not found by NTOOrb.
Error termination via Lnk1e in /scratch/g09/l601.exe
这是怎么回事？
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6楼2013-10-28 09:06:01
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 732749120 at 2013-10-28 09:06:01
我又改了改输入文件如下：
%chk=staten.chk
%mem=2500MW
# Geom=allcheck Chkbas Guess=(read,only) density=transition=148 Pop=(NTO,saveNTO)
结果又错了，错误如下：
Transition densities not found by N ...

出错信息提示没有找到跃迁密度。
输入文件看不出你有算激发态，只有基态，哪来第1~第148的跃迁密度？
可尝试下density=alltransition看是什么结果。

另外既然你是关心第600个激发态，为何跃迁密度只用到第148的？望指教~
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7楼2013-10-28 09:50:14
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-28 09:50:14
出错信息提示没有找到跃迁密度。
输入文件看不出你有算激发态，只有基态，哪来第1~第148的跃迁密度？
可尝试下density=alltransition看是什么结果。

另外既然你是关心第600个激发态，为何跃迁密度只用到第148 ...

我是想看看某个激发态下的某个轨道，如
Excited State 148:      Singlet-A      2.5266 eV  490.71 nm  f=0.0205  <S**2>=0.000
     271 ->303        -0.16944
     272 ->304        -0.20987
     273 ->303         0.29919
     274 ->303        -0.14255
     275 ->304         0.15035
     280 ->304        -0.16007
     283 ->305         0.14589
     289 ->307         0.10030
     290 ->307        -0.16766
     290 ->308        -0.12994
     293 ->307        -0.10140
     294 ->309         0.12905
     298 ->310         0.11517
     301 ->314        -0.10997
我是想看看273 ->303  到底是哪个轨道到哪个轨道
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8楼2013-10-28 10:06:40
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-28 09:50:14
出错信息提示没有找到跃迁密度。
输入文件看不出你有算激发态，只有基态，哪来第1~第148的跃迁密度？
可尝试下density=alltransition看是什么结果。

另外既然你是关心第600个激发态，为何跃迁密度只用到第148 ...

你有什么好的方法吗？望指教
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9楼2013-10-28 10:08:30
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
732749120: 金币+10, ★有帮助 2013-10-29 17:08:18
引用回帖:
9楼: Originally posted by 732749120 at 2013-10-28 10:08:30
你有什么好的方法吗？望指教...

我觉得你可以先找一个小分子，用你理解的方法，跑优化，算下td，用density=transition=1，尝试能不能正常跑完。
等能正常跑完了，再来算你的目标体系。
这样过一遍，至少能保证解决你在命令行输入上所遇到的问题。
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10楼2013-10-28 11:06:12
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