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tim562944200

金虫 (小有名气)

[求助] 关于MS力场编辑

我想用MS做个LJ流体的简单模拟,在forcite->forcefield manager下编辑力场,在interactions选项要输入各个LJ参数,但是我查到的LJ参数都是分子的参数,而下拉菜单中都是原子选项,该怎么处理呢?求大侠指导
关于MS力场编辑
lj参数.png
关于MS力场编辑-1
烦人.png



[ Last edited by tim562944200 on 2013-10-16 at 17:18 ]
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tim562944200

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Voland at 2013-10-17 00:06:48
去力场文件里面改,一般来说是改UFF力场和Dreiding力场,具体看你要改了力场做啥,吸附的话,用Dreiding力场就行了,σ*(2^(1/6))然后ε/503.2即可。

谢谢回复,还想求教一下,一个分子的LJ参数具体的定义,比如我查到了正辛烷分子的σ,ε,那么是指碳原子和碳原子之间还是碳原子和氢原子之间的LJ势参数呢?
7楼2013-10-17 09:48:34
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
LJ流体不就是一个一个的原子吗?
2楼2013-10-16 17:20:17
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tim562944200

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-10-16 17:20:17
LJ流体不就是一个一个的原子吗?

谢谢大侠回复,LJ势函数应该指的是各原子之间的非键相互作用,这个我知道,举个例子,我查到了氧气 和甲烷的LJ参数σ,ε,那么我设定 氧原子和碳原子之间的范德华力时应该怎么设定σ ,ε呢?
3楼2013-10-16 18:45:13
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by tim562944200 at 2013-10-16 18:45:13
谢谢大侠回复,LJ势函数应该指的是各原子之间的非键相互作用,这个我知道,举个例子,我查到了氧气 和甲烷的LJ参数σ,ε,那么我设定 氧原子和碳原子之间的范德华力时应该怎么设定σ ,ε呢?...

你说的不是LJ流体吗?怎么氧气甲烷都出来了
4楼2013-10-16 19:00:10
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