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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 单个分子的大小（就是单个分子的长和宽），能计算吗？有没有其他方法来确定？
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qtx0521

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 单个分子的大小（就是单个分子的长和宽），能计算吗？有没有其他方法来确定？

单个分子的大小（就是单个分子的长和宽），能计算吗？有没有其他方法来确定？
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1楼 2013-10-15 10:47:45
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bittersmile

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qtx0521: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-15 14:17:46
gmy1990: 金币+3 2013-10-15 19:02:27
分子的体积一般有两种算法：一种就是用硬球模型求体积，一种是用esp的iso surface包围的体积。前者比较简单，后者gaussian和aim都可以算。
另外说分子长宽应该不好判断，因为包住整个分子的长方体肯定不是唯一的。一般算出体积后最多是换算成球体体积，球体的半径大小差不多能指示分子体积。这个半径在gaussian的体积结果里也会给出。你仔细看看gaussian的volume关键词相关。
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4楼2013-10-15 12:19:21
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
指的是键长还是什么？从结构优化结果里根据笛卡尔坐标就可以算出来了吧？
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2楼2013-10-15 11:04:18
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qtx0521

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-15 11:04:18
指的是键长还是什么？从结构优化结果里根据笛卡尔坐标就可以算出来了吧？

单个分子的长和宽——就是分子的尺寸……
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3楼2013-10-15 11:41:33
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qtx0521

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by bittersmile at 2013-10-15 12:19:21
分子的体积一般有两种算法：一种就是用硬球模型求体积，一种是用esp的iso surface包围的体积。前者比较简单，后者gaussian和aim都可以算。
另外说分子长宽应该不好判断，因为包住整个分子的长方体肯定不是唯一的。 ...

已经通过CCDC晶体结构解决了……多谢……
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5楼2013-10-15 14:17:26
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