24小时热门版块排行榜    

查看: 3777  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

play900325

铁虫 (小有名气)

[求助] 为什么会出现l9999错误及过渡态初始结构怎么设定?

小女子刚接触高斯不久,主要是算过渡态的。在计算的过程中经常遇到l9999错误。我查了g09程序结构的说明,上面说l9999是计算结束并总结计算结果的link。但是在解决这个问题时,我一般是调整初始分子结构或者直接将错误结果拿出来接着算。这样虽然能够继续计算下去,但是优化出来的东西一看就不是我要的过渡态结构。现在我想问一下各位师兄师姐:
1.为什么会出现l9999错误,如果它指的是计算结束并总结计算结果的link,为什么在之前的计算中没有报错而卡到这里了,有人知道这一步是怎么运算的吗?
2.我用了ts方法来算过渡态,输入的过渡态是教科书上看来的,应该是没有错的,但是经过优化以后就面目全非了。log文件中四个优化检查item都是yes,也有唯一的虚频,虚频值也不小。我是否应该将过渡态的输入分子做调整,或者改别的地方?

谢谢各位!!
PS:我目前主要想弄清楚ts方法如何计算过渡态,所以关于qst2和qst3方法的解释请绕道~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by play900325 at 2013-10-10 17:06:56
第二个问题的输入文件:
%nprocshared=2
%mem=200MW
%chk=Cl.chk
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,z-matrix) freq b3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity temperature=300 pressure=2

Cl

1 1
C             ...

用ts这个选项做最重要的是你要对你想要的结构有个谱。然后把初始构型调到你想要的样子。
4楼2013-10-11 08:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

play900325

铁虫 (小有名气)

第二个问题的输入文件:
%nprocshared=2
%mem=200MW
%chk=Cl.chk
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,z-matrix) freq b3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity temperature=300 pressure=2

Cl

1 1
C                 -0.59487777   -0.59102614    0.21841270
H                 -0.09048594   -1.48269907   -0.09046958
H                 -0.09046633    0.12230075    0.83617790
H                 -1.60368132   -0.41268050   -0.09046951
Cl                -1.55217100   -1.33665219    1.58275235
Cl                 0.24552484    0.35092804   -1.00001566

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 0.5 6 0.5
2
3
4
5
6
2楼2013-10-10 17:06:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
l9999错误一般是指在规定的步数内没有达到收敛要求,优化未完成,对于你的来说就是还没找到过渡态,通过你的描述应该是构型变化太大导致的,可以尝试对初始构型作调整。
3楼2013-10-11 07:47:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
采用TS优化过渡态的时候,你必须保证你的初始结构接近过渡态,这样才会准确否则很容易出现L502和L9999错误。
处理L9999问题常用的有几种方法:
首先,如果的报错的结构没有跑,可以接着继续算;
再有,可以加大optcyc的数值,增大循环量;(对与小分子体系不太有效)
最后,你可以在计算之前先进行一个波长扫描。
我通常都用第三种方法。你出错的原因就是你的过渡态初始结构不合理,建议你试试修改结构。
越努力,越幸运!
5楼2013-10-11 10:51:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见