24小时热门版块排行榜    

查看: 3685  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

play900325

铁虫 (小有名气)

[求助] 为什么会出现l9999错误及过渡态初始结构怎么设定?

小女子刚接触高斯不久,主要是算过渡态的。在计算的过程中经常遇到l9999错误。我查了g09程序结构的说明,上面说l9999是计算结束并总结计算结果的link。但是在解决这个问题时,我一般是调整初始分子结构或者直接将错误结果拿出来接着算。这样虽然能够继续计算下去,但是优化出来的东西一看就不是我要的过渡态结构。现在我想问一下各位师兄师姐:
1.为什么会出现l9999错误,如果它指的是计算结束并总结计算结果的link,为什么在之前的计算中没有报错而卡到这里了,有人知道这一步是怎么运算的吗?
2.我用了ts方法来算过渡态,输入的过渡态是教科书上看来的,应该是没有错的,但是经过优化以后就面目全非了。log文件中四个优化检查item都是yes,也有唯一的虚频,虚频值也不小。我是否应该将过渡态的输入分子做调整,或者改别的地方?

谢谢各位!!
PS:我目前主要想弄清楚ts方法如何计算过渡态,所以关于qst2和qst3方法的解释请绕道~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by play900325 at 2013-10-10 17:06:56
第二个问题的输入文件:
%nprocshared=2
%mem=200MW
%chk=Cl.chk
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,z-matrix) freq b3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity temperature=300 pressure=2

Cl

1 1
C             ...

用ts这个选项做最重要的是你要对你想要的结构有个谱。然后把初始构型调到你想要的样子。
4楼2013-10-11 08:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

play900325

铁虫 (小有名气)

第二个问题的输入文件:
%nprocshared=2
%mem=200MW
%chk=Cl.chk
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,z-matrix) freq b3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity temperature=300 pressure=2

Cl

1 1
C                 -0.59487777   -0.59102614    0.21841270
H                 -0.09048594   -1.48269907   -0.09046958
H                 -0.09046633    0.12230075    0.83617790
H                 -1.60368132   -0.41268050   -0.09046951
Cl                -1.55217100   -1.33665219    1.58275235
Cl                 0.24552484    0.35092804   -1.00001566

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 0.5 6 0.5
2
3
4
5
6
2楼2013-10-10 17:06:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
l9999错误一般是指在规定的步数内没有达到收敛要求,优化未完成,对于你的来说就是还没找到过渡态,通过你的描述应该是构型变化太大导致的,可以尝试对初始构型作调整。
3楼2013-10-11 07:47:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
采用TS优化过渡态的时候,你必须保证你的初始结构接近过渡态,这样才会准确否则很容易出现L502和L9999错误。
处理L9999问题常用的有几种方法:
首先,如果的报错的结构没有跑,可以接着继续算;
再有,可以加大optcyc的数值,增大循环量;(对与小分子体系不太有效)
最后,你可以在计算之前先进行一个波长扫描。
我通常都用第三种方法。你出错的原因就是你的过渡态初始结构不合理,建议你试试修改结构。
越努力,越幸运!
5楼2013-10-11 10:51:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 7/350 2026-09-01 15:18 by myrtle
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见