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树栽子047

铁虫 (初入文坛)

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[求助] 请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？

分子动力学模拟的过程，我比较了解了，希望谁说下分子力学模拟，希望能说下过程是怎样的，呵呵

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严于律己，宽于待人

1楼 2013-10-09 21:14:54

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mbchen

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2013-12-03 08:36:44

还需要提醒的是，通常往往过分夸大了分子力学的威力。
1）分子力学只能计算势能的相对值。是相对于你所研究的具体分子在其键长、键角、两面角……均为“标准值”时而言的。这是分子力学的能量零点，不同的分子的能量零点也不同，这是与量子力学方法非常不同又重要的一点。

2）量子力学方法的能量零点是其中所有电子和原子核两两均相距无穷大时的能量设为零。所以，量子力学方法可以比较不同分子之间内部相互作用势能的大小。而这点是分子力学做不到的。

3）“分子力学”总共才5、6个表达式，居然也称“……力学”，所以它是个极为夸张的名词。而翻开任何一本《……力学》的书其中包含几百个表达式是不稀罕的。只有《molecular mechanics》(1987)胆敢凭不到10个方程就称“力学”了。

4）但是，我不是小看分子力学。正如计算机领域，1980年左右是在Atari、Commerdore、苹果机等游戏机市场的威胁下，巨无霸IBM才低头做PC机的，直到今天PC机几乎盖过了巨型计算机。而在理论化学领域也是那样，本来在理论化学家眼中区区地位的分子力学出世后，尽管粗糙但却使整个科学界在屏幕上看到了活生生的分子图像。于是，出现催生了“分子模拟”、“药物设计”、“材料设计”，理论化学的地位才提高了。

附带提到：“药物设计”这个词早在1968年左右就有了。但是那与1980年代计算机之后的“药物设计”在具体思想和做法上都有了很大改变。不能同日而语。