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请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？
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| 分子动力学模拟的过程，我比较了解了，希望谁说下分子力学模拟，希望能说下过程是怎样的，呵呵 |
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分子力学和分子动力学模拟是两个概念。归结如下： 1）分子力学只是一个粗略计算分子能量的方法。至于你说的“分子力学模拟”只能理解为用分子力学计算指定结构的能量。若将“分子力学”与“能量优化方法”两者结合，则就可以改变分子结构，从给定的分子结构开始，逐步改变结构寻找最近邻的能量的局部极小点。 2）分子动力学模拟是个真正可以将分子结构动起来的方法，至于其中需要哪个方法计算每一步的能量，可以有多种选择。只不过目前大多数选择分子力学计算而已。而选用量子力学方法计算能量太耗计算资源。分子动力学可以跨域势能面位垒，所以可以达到相空间中远处的状态，于是可以寻找全局的能量最低点，而不仅是“能量优化方法”寻找的最近的局部极小点。 3）称得上“模拟”的方法，其实只有分子动力学、Monte Carlo方法两种。其他如元胞自动机方法、遗传算法等的重要性较小。 |
5楼2013-10-10 10:22:27
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