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树栽子047

铁虫 (初入文坛)

[求助] 请问,分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢?

分子动力学模拟的过程,我比较了解了,希望谁说下分子力学模拟,希望能说下过程是怎样的,呵呵
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-03 08:36:25
分子力学不能模拟 只能优化 通过一些算法得到体系能量的极小值或者全局最小值

比较常见的应用是团簇结构优化或者有机大分子结构优化
3楼2013-10-10 00:55:20
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-03 08:36:19
个人理解,分子力学研究的是T=0K,体系最优的构型是什么样子的。分子动力学研究T>0K,通过分子运动的动力学统计出体系的宏观性质。
2楼2013-10-09 22:55:02
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树栽子047

铁虫 (初入文坛)

可以简单叙述下过程吗

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
严于律己,宽于待人
4楼2013-10-10 07:49:59
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mbchen

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-12-03 08:36:35
分子力学和分子动力学模拟是两个概念。归结如下:
1)分子力学只是一个粗略计算分子能量的方法。至于你说的“分子力学模拟”只能理解为用分子力学计算指定结构的能量。若将“分子力学”与“能量优化方法”两者结合,则就可以改变分子结构,从给定的分子结构开始,逐步改变结构寻找最近邻的能量的局部极小点。
2)分子动力学模拟是个真正可以将分子结构动起来的方法,至于其中需要哪个方法计算每一步的能量,可以有多种选择。只不过目前大多数选择分子力学计算而已。而选用量子力学方法计算能量太耗计算资源。分子动力学可以跨域势能面位垒,所以可以达到相空间中远处的状态,于是可以寻找全局的能量最低点,而不仅是“能量优化方法”寻找的最近的局部极小点。
3)称得上“模拟”的方法,其实只有分子动力学、Monte Carlo方法两种。其他如元胞自动机方法、遗传算法等的重要性较小。
5楼2013-10-10 10:22:27
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