24小时热门版块排行榜    

查看: 3286  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

雾溪之魅

银虫 (小有名气)

[求助] 求助l202错误

出现这个错误:
Atoms too close.
Error termination via Lnk1e in /home_soft/soft/x86_64/apps/CompChem/g09/l202.exe at Wed Oct  9 17:29:30 2013.

明明在开始原子之间距离很大,为什么优化过程中就拉近距离最后出现这个atoms too close 的错误呢。谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

这里的分层是指Gaussian软件的ONIOM计算,类似QM/MM。
就是将一个比较大的体系分成多个部分,每个部分根据关注程度的不同使用不同精度的方法。
如果使用gen pseudo=read在ONIOM计算中有时会有基组和赝势定义混乱的现象,为此,Gaussian中专门设计了genecp关键词。
对于非ONIOM计算,也就是非分层体系,genecp和gen pseudo=read的意思是完全一样的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
12楼2013-10-10 10:14:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-10-10 03:11:57
用GuassianView打开 输出文件看看每一步怎么变化吧。

尤其是第一步,会不会因为距离单位搞错了之类,输入的跟你想的不一样。
2楼2013-10-09 22:25:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种情况一般是有原子重叠或者交叉在一起了。可用GV打开你的gjf文件看下初始输入,也可根据楼上所说的打开输出文件看下每步循环。
还有不知道你是不是设了点群?如果设了点群,是不是只要写一部分原子坐标即可?高斯下我不设点群不知道对不对,GAMESS下是可以这样写的。
3楼2013-10-10 07:25:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个一定是体系中有重原子,对该原子使用了赝势基组,但是忘了定义赝势。
这相当于人为的移除了重原子的内层电子,
因此优化中,围绕重原子的原子间距会越来越短,短到极不正常就会出现这个错误。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
4楼2013-10-10 08:34:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 01:04 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-30 00:59 by winsaint
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:52 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:41 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 00:41 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 3/150 2026-08-29 21:35 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见